93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2010 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2010  polysaccharide export protein  100 
 
 		 422 aa  855    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.054742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1429  polysaccharide export protein  59.2 
 
 		 435 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1699  polysaccharide export protein  55.8 
 
 		 420 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.126093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2946  polysaccharide export protein  55.47 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3795  cold shock protein  42.32 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3249  polysaccharide biosynthesis/export protein  41.14 
 
 		 425 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2678  polysaccharide export protein  38.51 
 
 		 347 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 869 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  27.72 
 
 		 852 aa  67  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 454 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 947 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  25.26 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  25.36 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  25.86 
 
 		 915 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 931 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  29.57 
 
 		 551 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  25.63 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  32.35 
 
 		 221 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  26.88 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 921 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 186 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  26.4 
 
 		 606 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  30.27 
 
 		 196 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  28.11 
 
 		 212 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 920 aa  53.1  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  28.9 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  26.04 
 
 		 830 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  26.44 
 
 		 912 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  24.71 
 
 		 922 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 828 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  27.27 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  25.57 
 
 		 919 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  25.95 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  24.18 
 
 		 910 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  27.53 
 
 		 603 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  26.26 
 
 		 828 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 192 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  27.98 
 
 		 407 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25 
 
 		 919 aa  49.7  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  24.73 
 
 		 214 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  25.88 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  23.83 
 
 		 579 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  26.92 
 
 		 206 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  24.86 
 
 		 781 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.1 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  25.17 
 
 		 508 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  25.82 
 
 		 606 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  24.71 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  24.88 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  25.1 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  33.65 
 
 		 216 aa  47.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  24 
 
 		 948 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  22.87 
 
 		 552 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  25.14 
 
 		 609 aa  47  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  25.1 
 
 		 392 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.92 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  25.21 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  25.51 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  23.46 
 
 		 828 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  24.59 
 
 		 552 aa  45.8  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  23.6 
 
 		 897 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  23.46 
 
 		 837 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  22.95 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  23.46 
 
 		 837 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.31 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 196 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.31 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.31 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.31 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.31 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.31 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.31 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  23.46 
 
 		 837 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 219 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  34.41 
 
 		 238 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  29.9 
 
 		 193 aa  44.3  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.66 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  26.09 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  24.42 
 
 		 605 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  26.09 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  24.79 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  22.34 
 
 		 552 aa  43.5  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 234 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  29.03 
 
 		 175 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  25.52 
 
 		 833 aa  43.5  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  24.79 
 
 		 387 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  23.94 
 
 		 552 aa  43.5  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  20.4 
 
 		 830 aa  43.5  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  24.79 
 
 		 387 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  21.83 
 
 		 869 aa  43.1  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>