88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2007 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2007  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 442 aa  879    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1696  polysaccharide biosynthesis protein  58.18 
 
 		 454 aa  478  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.235327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1426  polysaccharide biosynthesis protein  59.71 
 
 		 455 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2949  polysaccharide biosynthesis protein  60.24 
 
 		 455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.484076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  36.14 
 
 		 424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  32.77 
 
 		 423 aa  222  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  31.77 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3801  polysaccharide biosynthesis export protein-like  24.28 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3244  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109073  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 507 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 		 480 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  26.54 
 
 		 509 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  22.3 
 
 		 501 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.27 
 
 		 508 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.61 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  23.43 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.42 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 503 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  22.93 
 
 		 492 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  24.34 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.84 
 
 		 492 aa  57  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 486 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  23.27 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 492 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  23.27 
 
 		 474 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.84 
 
 		 492 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.06 
 
 		 504 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4254  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.16434 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.84 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.84 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 499 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.84 
 
 		 492 aa  53.9  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.57 
 
 		 483 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  22.44 
 
 		 510 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  22.44 
 
 		 503 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  22.44 
 
 		 510 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  22.44 
 
 		 510 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  22.44 
 
 		 510 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.73 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.73 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 488 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3132  polysaccharide biosynthesis protein  24.8 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415164  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 504 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0847  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.875823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 		 490 aa  50.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  24.07 
 
 		 498 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2723  polysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180264  normal  0.985794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0698  polysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0788223  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21000  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.6 
 
 		 445 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 499 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  24.82 
 
 		 504 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  23.75 
 
 		 510 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2583  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  28.42 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  22.7 
 
 		 502 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  20.8 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  22.09 
 
 		 479 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  20.58 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 514 aa  44.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  22.91 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 504 aa  44.3  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  23.74 
 
 		 497 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  18.93 
 
 		 491 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2913  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.953336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 497 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  27.87 
 
 		 511 aa  43.5  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  21.75 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>