14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1612 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1612  hypothetical protein  100 
 
 		 622 aa  1245    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0939713  normal  0.0780144 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1624  hypothetical protein  30.28 
 
 		 634 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3852  hypothetical protein  28.86 
 
 		 989 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000234883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  29.41 
 
 		 3474 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.36 
 
 		 1779 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  24.76 
 
 		 656 aa  50.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  31.45 
 
 		 2853 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  26.96 
 
 		 3244 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  26.05 
 
 		 868 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0757  hypothetical protein  37.5 
 
 		 386 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00827619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0768  hypothetical protein  37.5 
 
 		 385 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1750 aa  44.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  26.36 
 
 		 1421 aa  44.3  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  26.09 
 
 		 2079 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>