More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1489 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  91.28 
 
 
517 aa  982    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  96.12 
 
 
517 aa  1026    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  77.84 
 
 
519 aa  843    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  80.43 
 
 
519 aa  868    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  100 
 
 
517 aa  1063    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  81.12 
 
 
519 aa  866    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  47.11 
 
 
506 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  47.11 
 
 
506 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  46.51 
 
 
506 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  46.71 
 
 
506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  46.88 
 
 
506 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  46.28 
 
 
506 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  44.21 
 
 
510 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3897  flavocytochrome c  47.42 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.513243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  45.62 
 
 
506 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  43.67 
 
 
517 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  42.02 
 
 
512 aa  398  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  43.37 
 
 
517 aa  382  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  41.94 
 
 
515 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  40.62 
 
 
500 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  40.7 
 
 
511 aa  374  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  41.7 
 
 
494 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  42.18 
 
 
483 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  39.96 
 
 
521 aa  361  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  39.45 
 
 
518 aa  361  1e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  39.53 
 
 
521 aa  360  5e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  39.84 
 
 
499 aa  359  5e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  42.88 
 
 
519 aa  360  5e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  38.4 
 
 
500 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  37.92 
 
 
507 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  41.54 
 
 
520 aa  345  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0299  flavocytochrome c  40.78 
 
 
506 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0588345 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0254  flavocytochrome c  48.08 
 
 
367 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 
511 aa  339  5.9999999999999996e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1414  flavocytochrome c flavin subunit, putative  40.35 
 
 
506 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2534  flavocytochrome c  40.78 
 
 
506 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0325  flavocytochrome c  39.24 
 
 
507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  39.7 
 
 
503 aa  322  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  39.32 
 
 
505 aa  315  9e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  36.4 
 
 
508 aa  295  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  33.59 
 
 
505 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.27 
 
 
584 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  35.7 
 
 
609 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  35.45 
 
 
515 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  35.8 
 
 
515 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  35.52 
 
 
515 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  33.11 
 
 
599 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  36.11 
 
 
582 aa  240  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  31.25 
 
 
501 aa  239  9e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.93 
 
 
582 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  32 
 
 
491 aa  232  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  36.51 
 
 
582 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  33.82 
 
 
586 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  34.38 
 
 
605 aa  226  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  34.05 
 
 
588 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  35.53 
 
 
582 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  35.53 
 
 
582 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  32.62 
 
 
586 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  34.25 
 
 
606 aa  221  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  31.91 
 
 
464 aa  221  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.06 
 
 
457 aa  217  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  33.26 
 
 
596 aa  213  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  33.33 
 
 
596 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  32.84 
 
 
589 aa  213  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  33.12 
 
 
596 aa  211  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  32.91 
 
 
596 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  33.05 
 
 
597 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  33.69 
 
 
596 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  33.69 
 
 
596 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  33.69 
 
 
596 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  33.69 
 
 
596 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  33.62 
 
 
603 aa  209  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  32.9 
 
 
589 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  32.77 
 
 
593 aa  207  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  32.26 
 
 
597 aa  205  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.92 
 
 
591 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  33.26 
 
 
596 aa  203  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  33.41 
 
 
591 aa  204  5e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  31.92 
 
 
598 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  33.7 
 
 
596 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.19 
 
 
465 aa  200  5e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  32.45 
 
 
596 aa  200  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  33.61 
 
 
596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.25 
 
 
502 aa  197  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1545  putative flavocytochrome c flavin subunit  29.78 
 
 
447 aa  194  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  31.63 
 
 
598 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  30.15 
 
 
596 aa  193  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  31.82 
 
 
925 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  31.62 
 
 
598 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  31.8 
 
 
583 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  31 
 
 
608 aa  189  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  31.82 
 
 
925 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  30.49 
 
 
504 aa  184  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  31.57 
 
 
957 aa  179  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.89 
 
 
589 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  28.29 
 
 
926 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  29.15 
 
 
637 aa  169  9e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  29.85 
 
 
650 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  32.16 
 
 
616 aa  162  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  29.68 
 
 
631 aa  157  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>