61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1454 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2767  hypothetical protein  75.53 
 
 
569 aa  849    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.170207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  85.38 
 
 
555 aa  954    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  96.93 
 
 
553 aa  1087    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1591  hypothetical protein  76.38 
 
 
564 aa  867    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0414272  unclonable  0.00000000000672446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  74.19 
 
 
547 aa  830    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  96.01 
 
 
552 aa  1075    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2862  hypothetical protein  76.55 
 
 
564 aa  850    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  100 
 
 
553 aa  1125    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2787  hypothetical protein  76.2 
 
 
564 aa  847    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.352279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2683  hypothetical protein  54.97 
 
 
544 aa  598  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.382096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2605  hypothetical protein  53.67 
 
 
544 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.634238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  55.83 
 
 
544 aa  588  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3033  hypothetical protein  52.87 
 
 
548 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0228432  normal  0.0454069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2432  hypothetical protein  53.85 
 
 
546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1523  hypothetical protein  51.24 
 
 
586 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2174  hypothetical protein  47.19 
 
 
540 aa  488  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0809716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  33.5 
 
 
581 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  43.36 
 
 
584 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02707  batD protein  38.01 
 
 
586 aa  280  6e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2817  hypothetical protein  32.64 
 
 
555 aa  213  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.683396  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  29.56 
 
 
546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  28.65 
 
 
551 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001267  BatD  25.99 
 
 
548 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  28.9 
 
 
595 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  28.55 
 
 
544 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  28.09 
 
 
568 aa  177  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  27.82 
 
 
543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  27.82 
 
 
543 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  30.04 
 
 
546 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  27.85 
 
 
552 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  29.27 
 
 
543 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  29.48 
 
 
543 aa  170  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  28.55 
 
 
570 aa  166  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  27.18 
 
 
541 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  25.96 
 
 
548 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  28.61 
 
 
580 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  28.15 
 
 
544 aa  160  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  27.36 
 
 
550 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  25.89 
 
 
549 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  27.97 
 
 
549 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02343  hypothetical protein  24.37 
 
 
585 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  28.21 
 
 
566 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  28.46 
 
 
589 aa  124  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.06 
 
 
611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3230  hypothetical protein  26.56 
 
 
571 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  25.84 
 
 
458 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  25.93 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1389  hypothetical protein  22.63 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.202962  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2466  hypothetical protein  21.7 
 
 
431 aa  50.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.662294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0439  hypothetical protein  22.09 
 
 
572 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00635902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0211  hypothetical protein  21.16 
 
 
447 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.829606  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  28.23 
 
 
438 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  21.71 
 
 
430 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  27.42 
 
 
476 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  23.78 
 
 
472 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1484  hypothetical protein  21.53 
 
 
614 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100241  normal  0.558866 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  25.87 
 
 
475 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1131  hypothetical protein  24.27 
 
 
398 aa  43.9  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2394  hypothetical protein  24.48 
 
 
871 aa  43.9  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.700613 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1679  hypothetical protein  26.67 
 
 
454 aa  43.9  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0510634  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  21.87 
 
 
414 aa  43.5  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>