24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1452 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1452  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.389327  unclonable  0.0000000000496507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1399  hypothetical protein  97.01 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.205133  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1464  hypothetical protein  95.3 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  hitchhiker  0.001985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3097  hypothetical protein  89.74 
 
 		 234 aa  435  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2864  hypothetical protein  84.19 
 
 		 234 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.420562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2789  hypothetical protein  83.76 
 
 		 234 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00603172  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2769  hypothetical protein  84.19 
 
 		 234 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0144163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1589  hypothetical protein  83.33 
 
 		 234 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  unclonable  0.00000000000333402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2468  hypothetical protein  79.49 
 
 		 234 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.205241  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2434  hypothetical protein  64.96 
 
 		 234 aa  328  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0112124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1620  hypothetical protein  66.67 
 
 		 234 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313028  hitchhiker  0.00000317582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2607  hypothetical protein  64.53 
 
 		 234 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3035  hypothetical protein  63.68 
 
 		 234 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal  0.0353116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2176  hypothetical protein  59.83 
 
 		 234 aa  298  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00337144  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1521  hypothetical protein  60.26 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2685  hypothetical protein  59.15 
 
 		 235 aa  294  7e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0316068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1655  hypothetical protein  40.69 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3166  hypothetical protein  35.59 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00141395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02710  hypothetical protein  35.04 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002853  hypothetical protein  34.89 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0562  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0947  hypothetical protein  34.57 
 
 		 188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03123  hypothetical protein  31.93 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1770  hypothetical protein  22.59 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>