82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1301 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  59.03 
 
 		 822 aa  974    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  65.37 
 
 		 821 aa  1109    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  60.8 
 
 		 822 aa  1013    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  43.23 
 
 		 841 aa  675    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  100 
 
 		 823 aa  1702    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  59.64 
 
 		 820 aa  981    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  43.49 
 
 		 833 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  42.51 
 
 		 826 aa  631  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  40.19 
 
 		 824 aa  579  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  38.48 
 
 		 825 aa  568  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  37.94 
 
 		 826 aa  544  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  30.89 
 
 		 841 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 826 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 826 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 839 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  30.52 
 
 		 837 aa  347  6e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  28.76 
 
 		 833 aa  307  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  30.05 
 
 		 812 aa  248  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  24.17 
 
 		 871 aa  197  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  26.8 
 
 		 429 aa  77  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  24.24 
 
 		 618 aa  71.6  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  26.48 
 
 		 430 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  27.24 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  26.81 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  29.65 
 
 		 700 aa  67  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  24.32 
 
 		 441 aa  67.4  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  26.4 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  26.4 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  27.56 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  22.91 
 
 		 625 aa  64.3  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  22.86 
 
 		 673 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  24.93 
 
 		 638 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  21.16 
 
 		 616 aa  62.4  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  25.42 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  25.42 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  24.03 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  23.78 
 
 		 433 aa  60.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  26.22 
 
 		 507 aa  60.1  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  24.59 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  25.88 
 
 		 604 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  24.3 
 
 		 629 aa  59.3  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  22.87 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  24.66 
 
 		 649 aa  58.9  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  23.96 
 
 		 570 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  27.13 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  22.44 
 
 		 627 aa  57.8  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  23.2 
 
 		 632 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  24.32 
 
 		 626 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  26.45 
 
 		 605 aa  55.5  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  23.2 
 
 		 578 aa  54.3  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  25.67 
 
 		 608 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 313 aa  53.9  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  21.97 
 
 		 578 aa  52.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  24.77 
 
 		 638 aa  52  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  24.07 
 
 		 560 aa  52  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  21.6 
 
 		 662 aa  51.2  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  28.66 
 
 		 607 aa  51.2  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  25.77 
 
 		 605 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  25.16 
 
 		 605 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  28.57 
 
 		 577 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  23.23 
 
 		 676 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 191 aa  48.9  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 		 297 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 		 297 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  33.33 
 
 		 545 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  22.76 
 
 		 661 aa  47.8  0.0009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  20.73 
 
 		 891 aa  47.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 		 616 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 615 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  20.19 
 
 		 648 aa  47  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.88 
 
 		 370 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  23.99 
 
 		 671 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 3145 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3564  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 637 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 638 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  32.81 
 
 		 308 aa  46.2  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  18.65 
 
 		 626 aa  45.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  31.03 
 
 		 623 aa  45.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 638 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3053  hypothetical protein  20.72 
 
 		 1179 aa  44.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 750 aa  44.3  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  20.23 
 
 		 702 aa  44.3  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>