19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1176 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1176  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  237  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0641915  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1175  hypothetical protein  99.12 
 
 
114 aa  235  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166401  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1246  hypothetical protein  96.49 
 
 
114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3044  hypothetical protein  85.09 
 
 
114 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.511414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3374  hypothetical protein  86.84 
 
 
114 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1319  hypothetical protein  84.21 
 
 
114 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.181479  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3058  hypothetical protein  84.21 
 
 
114 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0202698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3201  hypothetical protein  84.21 
 
 
114 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.50752  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2705  hypothetical protein  82.46 
 
 
114 aa  207  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00514172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0961  hypothetical protein  73.68 
 
 
114 aa  192  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199387  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1109  hypothetical protein  74.56 
 
 
114 aa  192  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.249921  normal  0.981627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1039  hypothetical protein  73.68 
 
 
114 aa  190  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0141429  normal  0.686037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2654  hypothetical protein  74.56 
 
 
114 aa  189  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000435308  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3027  hypothetical protein  66.67 
 
 
114 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00221718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0931  hypothetical protein  70.18 
 
 
114 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3035  hypothetical protein  63.16 
 
 
114 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1088  hypothetical protein  27 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003446  hypothetical protein  25.53 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00494887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02329  hypothetical protein  27.66 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>