More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1159 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3061  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  88.45 
 
 
355 aa  651    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000791225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3392  oxidoreductase, FMN-binding  89.58 
 
 
355 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1159  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  100 
 
 
355 aa  726    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1293  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  88.17 
 
 
355 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  88.45 
 
 
355 aa  650    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2720  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  87.32 
 
 
355 aa  647    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1158  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  99.15 
 
 
355 aa  721    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.704558  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1229  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  98.31 
 
 
355 aa  716    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1249  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  88.73 
 
 
355 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4055  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  77.23 
 
 
350 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1230  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  79.36 
 
 
347 aa  549  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1089  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  75.72 
 
 
347 aa  531  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0240  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  73.98 
 
 
347 aa  527  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1397  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  74.14 
 
 
351 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.3301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3644  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  76.08 
 
 
350 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.055572 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3098  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  70.93 
 
 
346 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.450355  normal  0.838165 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2407  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  73.39 
 
 
347 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2779  hypothetical protein  52.33 
 
 
351 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6347  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.16 
 
 
363 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2058  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.62 
 
 
363 aa  291  8e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1327  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.52 
 
 
364 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1368  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.02 
 
 
367 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0423  FMN oxidoreductase protein  46.57 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2240  N-ethylmaleimide reductase, FMN-linked  46.09 
 
 
365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1865  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  45.24 
 
 
360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1721  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.92 
 
 
363 aa  283  5.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1258  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.35 
 
 
371 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2277  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.66 
 
 
363 aa  280  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.178772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3683  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.99 
 
 
368 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2173  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.51 
 
 
363 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.789599  hitchhiker  0.00631395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4210  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.29 
 
 
372 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3698  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.9 
 
 
364 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014573 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4103  N-ethylmaleimide reductase  45.59 
 
 
369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0920  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.48 
 
 
349 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3689  GTN reductase  45.11 
 
 
360 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4675  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.95 
 
 
353 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.650243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1120  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.29 
 
 
349 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.395455 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5550  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.58 
 
 
358 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.088188  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.9 
 
 
364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15352  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0986  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.87 
 
 
349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000257245 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4150  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.25 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4736  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.67 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5271  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.96 
 
 
360 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0959  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.18 
 
 
349 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1172  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.22 
 
 
359 aa  269  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.210538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56660  xenobiotic reductase  44.78 
 
 
350 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2479  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.8 
 
 
366 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4760  flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.75 
 
 
365 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000142373  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.48 
 
 
366 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0473  NADH:flavin oxidoreductase  46.69 
 
 
368 aa  267  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4062  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.84 
 
 
462 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00355793  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05639  N-ethylmaleimide reductase  42.09 
 
 
366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4468  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.57 
 
 
349 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.101693 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5805  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.79 
 
 
353 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.452386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4927  xenobiotic reductase  44.48 
 
 
350 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2018  putative N-ethylmaleimide reductase  44.79 
 
 
353 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.791001  normal  0.023954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.98 
 
 
369 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0951  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.65 
 
 
353 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37800  NADH:flavin xenobiotic reductase  43.16 
 
 
349 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0507  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.84 
 
 
363 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0101  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.68 
 
 
369 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.70129 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000261  N-ethylmaleimide reductase  42.09 
 
 
366 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1830  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.59 
 
 
358 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.028835  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1282  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.85 
 
 
349 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5519  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.74 
 
 
353 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2348  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.73 
 
 
358 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3603  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.74 
 
 
353 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4764  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.74 
 
 
353 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.211845 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01763  GTN Reductase  46.02 
 
 
372 aa  263  4.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3889  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.35 
 
 
366 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.212192  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.22 
 
 
375 aa  262  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.656366  normal  0.303319 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001682  NADH:flavin oxidoreductases Old Yellow Enzyme family  44.41 
 
 
358 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5133  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.67 
 
 
374 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.249326  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2094  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.19 
 
 
368 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4064  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.51 
 
 
376 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3680  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  42.82 
 
 
375 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.204517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4808  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.79 
 
 
353 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.147658 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1539  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.26 
 
 
358 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.31269  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1523  N-ethylmaleimide reductase  45.4 
 
 
353 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.512635  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0481  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.98 
 
 
369 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1561  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  42.29 
 
 
375 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.342223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3892  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.05 
 
 
353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4063  N-ethylmaleimide reductase, putative  43.59 
 
 
367 aa  259  6e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.48 
 
 
358 aa  259  7e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3087  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.95 
 
 
370 aa  258  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1313  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.66 
 
 
352 aa  258  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5112  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.55 
 
 
372 aa  258  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2005  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.06 
 
 
359 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  0.0112821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3657  NADH-dependent flavin oxidoreductase, Oye family  42.13 
 
 
375 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.31 
 
 
375 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.736898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0217  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.14 
 
 
358 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2616  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.11 
 
 
365 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06498  NADH-flavin oxidoreductase  42.82 
 
 
363 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26130  morphinone reductase  42.69 
 
 
369 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.243745  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0306  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.88 
 
 
358 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126794  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1245  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.64 
 
 
373 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.298722 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3398  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  42.25 
 
 
375 aa  256  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1643  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  42.99 
 
 
387 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0593  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.07 
 
 
363 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2006  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.31 
 
 
364 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>