More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0970 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0970  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 362 aa  740    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.72 
 
 		 362 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2936  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.1 
 
 		 362 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3522  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.44 
 
 		 362 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.44 
 
 		 362 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1055  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.44 
 
 		 362 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655525  hitchhiker  0.0000230906 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.39 
 
 		 362 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.963071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1144  methyl-accepting chemotaxis protein  79.01 
 
 		 362 aa  598  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.11 
 
 		 362 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3185  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.43 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.87 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0524  methyl-accepting chemotaxis protein  51.79 
 
 		 367 aa  346  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04747  methyl-accepting chemotaxis protein  49.3 
 
 		 361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.84 
 
 		 361 aa  332  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2075  methyl-accepting chemotaxis protein  46.96 
 
 		 362 aa  325  6e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3384  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644477  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3310  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.740696  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3483  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3320  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 351 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.781767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3390  putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 351 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.927334 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03785  methyl-accepting chemotaxis protein  34.54 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2497  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.39 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.854874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0416  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.25 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.217637  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.55 
 
 		 442 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0447763  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 720 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.31 
 
 		 720 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0043  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.51 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  36.08 
 
 		 440 aa  133  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0157  chemotaxis sensory transducer  34.39 
 
 		 447 aa  132  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0930636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0981  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 635 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.779847  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0975  methyl-accepting chemotaxis protein  32.18 
 
 		 365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.245078  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0473  methyl-accepting chemotaxis protein  29.81 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0498  methyl-accepting chemotaxis protein  29.81 
 
 		 365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.654005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 641 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.8 
 
 		 495 aa  126  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 		 622 aa  121  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00784755  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1032  MCP-domain signal transduction protein  34.41 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.60166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  34.65 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.72 
 
 		 632 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  29.03 
 
 		 645 aa  113  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.6 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0016  chemotaxis sensory transducer  33.48 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.760621  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1521  methyl-accepting chemotaxis protein  30.61 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1836  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.58 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126283  normal  0.522282 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0962  MCP-domain signal transduction protein  38.22 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.73 
 
 		 674 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 433 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 483 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  58.06 
 
 		 629 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  58.06 
 
 		 632 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0574  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.87 
 
 		 815 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  58.06 
 
 		 632 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  58.06 
 
 		 629 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  58.06 
 
 		 629 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  58.06 
 
 		 629 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.07 
 
 		 700 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55750  putative chemotaxis transducer  33 
 
 		 538 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.19 
 
 		 700 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0606  methyl-accepting chemotaxis protein  44.26 
 
 		 587 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0511  methyl-accepting chemotaxis protein  34.73 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.737393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3417  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 		 583 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  57.3 
 
 		 629 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4857  methyl-accepting chemotaxis protein  30.96 
 
 		 535 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  55.81 
 
 		 627 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0412159  hitchhiker  0.0000400753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42.86 
 
 		 626 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  44.03 
 
 		 623 aa  100  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1016  methyl-accepting chemotaxis protein  47.41 
 
 		 563 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0643  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.51 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000131612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  32.64 
 
 		 306 aa  99.4  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.08 
 
 		 440 aa  99.4  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  45.04 
 
 		 476 aa  99.4  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.96 
 
 		 497 aa  99.4  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0763  methyl-accepting chemotaxis protein  43.48 
 
 		 661 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  53.76 
 
 		 629 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2016  methyl-accepting chemotaxis protein  35.96 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000104003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0685  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55 
 
 		 620 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.04 
 
 		 495 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000865197  normal  0.384283 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.04 
 
 		 495 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.04 
 
 		 495 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004525  methyl-accepting chemotaxis protein  36.32 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.32 
 
 		 628 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  42.11 
 
 		 643 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  47.41 
 
 		 672 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.57 
 
 		 716 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42.11 
 
 		 628 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  41.73 
 
 		 626 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 		 1079 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  31.91 
 
 		 547 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.67 
 
 		 499 aa  97.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  42.34 
 
 		 626 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 		 574 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.58 
 
 		 689 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.15 
 
 		 482 aa  97.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00569391  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  52.53 
 
 		 480 aa  97.1  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  42.42 
 
 		 623 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  55.17 
 
 		 630 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  44.27 
 
 		 545 aa  96.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1621  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 		 513 aa  97.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>