53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0822 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0822  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000109083  normal  0.209568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0853  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3119  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000717729  normal  0.542025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3096  hypothetical protein  98.23 
 
 		 226 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3455  hypothetical protein  96.9 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000227297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3770  hypothetical protein  96.9 
 
 		 226 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0917  hypothetical protein  96.9 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00343614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0907  protein of unknown function DUF47  96.9 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0883  hypothetical protein  96.9 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3487  hypothetical protein  86.28 
 
 		 226 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3843  hypothetical protein  83.63 
 
 		 226 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000724256  hitchhiker  0.0000000283379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0692  hypothetical protein  81.78 
 
 		 226 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0618  hypothetical protein  82.3 
 
 		 226 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.357102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0717  hypothetical protein  80.53 
 
 		 226 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000253337  unclonable  0.0000000117044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0565  hypothetical protein  81.33 
 
 		 226 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2673  hypothetical protein  76.11 
 
 		 226 aa  360  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2681  hypothetical protein  68.44 
 
 		 226 aa  324  8.000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0612362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00863  hypothetical protein  65.33 
 
 		 228 aa  317  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2019  hypothetical protein  65.33 
 
 		 228 aa  313  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582127  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3320  hypothetical protein  63.84 
 
 		 225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3638  hypothetical protein  63.56 
 
 		 226 aa  295  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0181  hypothetical protein  59.56 
 
 		 226 aa  287  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1190  phosphate transport regulator  58.22 
 
 		 226 aa  282  3.0000000000000004e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.967179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004528  phosphate transport regulator  65.46 
 
 		 195 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.327148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0351  hypothetical protein  53.33 
 
 		 225 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68800  hypothetical protein  52 
 
 		 225 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5953  hypothetical protein  51.56 
 
 		 225 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0634  hypothetical protein  49.33 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0618  hypothetical protein  49.33 
 
 		 223 aa  235  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2827  hypothetical protein  49.08 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2470  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0141  Putitive phosphate transport regulator  48.21 
 
 		 226 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.572504  normal  0.330321 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0711  hypothetical protein  51.57 
 
 		 226 aa  218  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2188  hypothetical protein  47.3 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.839701  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0138  putative pit accessory protein  46.4 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1052  hypothetical protein  46.54 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170442  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0228  hypothetical protein  43.56 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.775061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1146  Putitive phosphate transport regulator  30 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266401  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0063  hypothetical protein  29.03 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2044  hypothetical protein  29.15 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000405279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3224  hypothetical protein  27.15 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1625  hypothetical protein  28.44 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.109704  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0285  hypothetical protein  28.57 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0788  hypothetical protein  23.7 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0688  hypothetical protein  24.74 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000115743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0036  Putitive phosphate transport regulator  24.32 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0664  hypothetical protein  24.23 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000019589  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3780  phosphate transport regulator-like  27.34 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1923  hypothetical protein  23.04 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00116502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0013  hypothetical protein  23.3 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0013  hypothetical protein  23.3 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0493  hypothetical protein  21.6 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000213235  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1332  hypothetical protein  24.62 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>