217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0806 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  90.91 
 
 
396 aa  736    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3509  peptidase M19 renal dipeptidase  86.82 
 
 
388 aa  705    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3577  peptidase M19 renal dipeptidase  86.56 
 
 
388 aa  704    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  98.19 
 
 
387 aa  787    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  98.45 
 
 
387 aa  789    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 
387 aa  801    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3700  peptidase M19 renal dipeptidase  86.3 
 
 
388 aa  703    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0741  peptidase M19 renal dipeptidase  86.56 
 
 
388 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0838  peptidase M19, renal dipeptidase  85.49 
 
 
388 aa  692    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.994028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0751  twin-arginine translocation pathway signal  72.68 
 
 
391 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3183  twin-arginine translocation pathway signal  70.21 
 
 
388 aa  578  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  71.35 
 
 
388 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  68.23 
 
 
379 aa  544  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  64.19 
 
 
390 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  66.76 
 
 
385 aa  501  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  26.84 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  27.32 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  27.48 
 
 
323 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  27.04 
 
 
323 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  26.76 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  25.92 
 
 
323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  27.04 
 
 
323 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  27.04 
 
 
323 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  27.04 
 
 
323 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  27.04 
 
 
323 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  27.04 
 
 
323 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  25.71 
 
 
325 aa  112  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  27.24 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  27.24 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  26.76 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  27.04 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  27.04 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  27.24 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  27.24 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  25.78 
 
 
323 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  25.22 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  25.78 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  26.46 
 
 
386 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  27.76 
 
 
325 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  26.39 
 
 
315 aa  109  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  25.5 
 
 
323 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  25.88 
 
 
326 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  27.55 
 
 
329 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  26.21 
 
 
325 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  25.5 
 
 
323 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  24.6 
 
 
311 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  26.97 
 
 
320 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  26.94 
 
 
325 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  28.51 
 
 
336 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  24.31 
 
 
325 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  24.93 
 
 
323 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  24.93 
 
 
323 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  25.99 
 
 
324 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  23.91 
 
 
346 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  26.01 
 
 
325 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  26.14 
 
 
320 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  25.4 
 
 
325 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  24.51 
 
 
329 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  24.65 
 
 
323 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  24.65 
 
 
323 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  25.95 
 
 
320 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  24.65 
 
 
323 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  26.61 
 
 
377 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  25.72 
 
 
313 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  25.34 
 
 
332 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  25.82 
 
 
323 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  29.47 
 
 
311 aa  99.8  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  23.12 
 
 
329 aa  99.8  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  23.12 
 
 
329 aa  99.4  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  26.24 
 
 
328 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  26.7 
 
 
328 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  24.06 
 
 
333 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  28.28 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  23.82 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  23.47 
 
 
327 aa  93.6  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  32.8 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  24.79 
 
 
332 aa  92.8  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  24.78 
 
 
357 aa  92.8  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  27.27 
 
 
438 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0032  peptidase M19, renal dipeptidase  28.27 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  23.81 
 
 
332 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  23.66 
 
 
329 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  30.4 
 
 
433 aa  90.5  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3516  renal dipeptidase family protein  25.56 
 
 
307 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  24.72 
 
 
311 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.65 
 
 
312 aa  90.1  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  33.99 
 
 
315 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  30.14 
 
 
333 aa  89.7  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3624  renal dipeptidase family protein  25.56 
 
 
307 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0203729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3822  renal dipeptidase family protein  27.51 
 
 
307 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3911  renal dipeptidase family protein  25.56 
 
 
307 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.809372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3546  membrane dipeptidase  25.11 
 
 
307 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0243201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3787  renal dipeptidase family protein  25.56 
 
 
307 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3810  renal dipeptidase family protein  24.32 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  35.09 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  30 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  26.99 
 
 
335 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  25.32 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3874  renal dipeptidase family protein  24.66 
 
 
307 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.452188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3086  membrane dipeptidase  33.75 
 
 
350 aa  88.2  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>