190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0590 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0590  oligoribonuclease  100 
 
 		 181 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000254654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0591  oligoribonuclease  98.9 
 
 		 181 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.886614  hitchhiker  0.000123281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3439  oligoribonuclease  98.9 
 
 		 181 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.704694  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0592  oligoribonuclease  96.69 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0551  oligoribonuclease  95.03 
 
 		 181 aa  366  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000104193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3900  oligoribonuclease  95.03 
 
 		 181 aa  366  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3774  oligoribonuclease  95.03 
 
 		 181 aa  366  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00192179  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3717  oligoribonuclease  94.48 
 
 		 181 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.624227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3287  oligoribonuclease  94.48 
 
 		 181 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.161862  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3212  oligoribonuclease  83.43 
 
 		 181 aa  328  3e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00278248  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3317  oligoribonuclease  81.77 
 
 		 181 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000232212  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3032  oligoribonuclease  82.32 
 
 		 181 aa  323  7e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.102944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3547  oligoribonuclease  80.11 
 
 		 181 aa  321  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4178  oligoribonuclease  80.66 
 
 		 181 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0559  oligoribonuclease  80.11 
 
 		 181 aa  316  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.143761  normal  0.198605 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0790  oligoribonuclease  79.01 
 
 		 181 aa  312  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  hitchhiker  0.00115856 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3481  oligoribonuclease  65.75 
 
 		 181 aa  263  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3931  oligoribonuclease  66.85 
 
 		 180 aa  262  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4628  oligoribonuclease  66.3 
 
 		 181 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4619  oligoribonuclease  66.3 
 
 		 181 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4711  oligoribonuclease  66.3 
 
 		 181 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.036759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4747  oligoribonuclease  66.3 
 
 		 181 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00828868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4768  oligoribonuclease  66.3 
 
 		 181 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.0613691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3753  oligoribonuclease  65.73 
 
 		 180 aa  261  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0708  oligoribonuclease  68 
 
 		 181 aa  259  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.367398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0424  oligoribonuclease  65.19 
 
 		 181 aa  258  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000286047  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4954  oligoribonuclease  68 
 
 		 180 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.445881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3808  oligoribonuclease  67.43 
 
 		 181 aa  257  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3661  oligoribonuclease  67.43 
 
 		 181 aa  257  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04032  oligoribonuclease  64.09 
 
 		 181 aa  257  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000706599  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3828  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  64.09 
 
 		 181 aa  257  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000318857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4719  oligoribonuclease  64.09 
 
 		 181 aa  257  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000375023  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03994  hypothetical protein  64.09 
 
 		 181 aa  257  7e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000413347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4694  oligoribonuclease  64.09 
 
 		 181 aa  257  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  4.76072e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3848  oligoribonuclease  64.09 
 
 		 181 aa  257  7e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000498222  hitchhiker  0.0000133205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4403  oligoribonuclease  64.09 
 
 		 181 aa  257  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000656326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4633  oligoribonuclease  64.09 
 
 		 181 aa  257  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387491  normal  0.0592166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4693  oligoribonuclease  66.29 
 
 		 180 aa  257  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0476  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  65.34 
 
 		 180 aa  257  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4902  oligoribonuclease  67.43 
 
 		 180 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002252  oligoribonuclease  62.98 
 
 		 181 aa  256  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000410797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4778  oligoribonuclease  67.43 
 
 		 180 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0348  oligoribonuclease  64.09 
 
 		 181 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000355346  unclonable  0.00000209228 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00112  oligoribonuclease  62.43 
 
 		 181 aa  254  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5678  oligoribonuclease  63.54 
 
 		 181 aa  254  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000295119  normal  0.99134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0387  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  64.77 
 
 		 180 aa  253  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1847  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  63.54 
 
 		 188 aa  253  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0353601 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2783  oligoribonuclease  61.88 
 
 		 181 aa  252  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1502  oligoribonuclease  62.98 
 
 		 193 aa  250  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.678384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0628  oligoribonuclease  64.97 
 
 		 180 aa  250  9.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00551  oligoribonuclease  61.33 
 
 		 181 aa  248  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5680  oligoribonuclease  63.48 
 
 		 180 aa  247  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0515  oligoribonuclease  64.57 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460562  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2574  oligoribonuclease  61.14 
 
 		 205 aa  246  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65410  oligoribonuclease  62.92 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2743  oligoribonuclease  60.77 
 
 		 181 aa  245  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000147297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0539  oligoribonuclease  62.98 
 
 		 181 aa  245  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0586  oligoribonuclease  63.74 
 
 		 184 aa  244  4e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.51167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1994  oligoribonuclease  61.88 
 
 		 182 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0106356  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1670  oligoribonuclease  63.58 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1270  oligoribonuclease  58.89 
 
 		 187 aa  243  8e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.768994  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0907  oligoribonuclease  60.57 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1473  oligoribonuclease  60.23 
 
 		 183 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.777714  normal  0.355719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07470  oligoribonuclease  62.15 
 
 		 180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3001  oligoribonuclease  62.29 
 
 		 184 aa  240  7.999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2638  oligoribonuclease  59.12 
 
 		 185 aa  239  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0115664  hitchhiker  0.0000000947663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4192  oligoribonuclease  63.91 
 
 		 206 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.872573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1100  oligoribonuclease  59.12 
 
 		 184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0275698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3335  oligoribonuclease  60.67 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.475979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4379  oligoribonuclease  58.01 
 
 		 181 aa  238  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1080  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.67 
 
 		 181 aa  238  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4950  oligoribonuclease  62.64 
 
 		 178 aa  236  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0942  oligoribonuclease  60.34 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.012478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0564  oligoribonuclease  62.07 
 
 		 178 aa  235  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1016  oligoribonuclease  63.31 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2676  oligoribonuclease  59.67 
 
 		 181 aa  234  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0778  oligoribonuclease  62.72 
 
 		 207 aa  234  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101637 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1566  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  62.86 
 
 		 183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0341  oligoribonuclease  58.56 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0985  oligoribonuclease  62.29 
 
 		 187 aa  234  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1276  oligoribonuclease  58.19 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0268591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2968  oligoribonuclease  62.13 
 
 		 203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.139128  normal  0.188792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0324  oligoribonuclease  59.67 
 
 		 195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.224981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0225  oligoribonuclease  59.43 
 
 		 183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0254555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1839  oligoribonuclease  57.22 
 
 		 182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0525  oligoribonuclease  56.82 
 
 		 195 aa  231  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.214811  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2776  oligoribonuclease  56.42 
 
 		 180 aa  230  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5181  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  59.43 
 
 		 187 aa  230  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0884  oligoribonuclease  62.07 
 
 		 215 aa  230  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0813  oligoribonuclease  61.49 
 
 		 219 aa  230  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2958  oligoribonuclease  63.01 
 
 		 229 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0392  oligoribonuclease  63.01 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.484174  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1470  oligoribonuclease  58.62 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.255303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2535  oligoribonuclease  63.01 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0908  oligoribonuclease  63.01 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2848  oligoribonuclease  63.01 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2908  oligoribonuclease  63.01 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.4726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0239  oligoribonuclease  63.01 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0714  oligoribonuclease  57.14 
 
 		 184 aa  228  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.705267  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2797  oligoribonuclease  63.31 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>