201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0566 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0567  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0566  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3463  periplasmic solute binding protein  99.34 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0565  adhesion protein, putative  93.49 
 
 		 293 aa  568  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3741  periplasmic solute binding protein  89.4 
 
 		 302 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0527  periplasmic solute binding protein  89.4 
 
 		 302 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000427742  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3924  periplasmic solute binding protein  89.07 
 
 		 302 aa  563  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3798  periplasmic solute binding protein  89.4 
 
 		 302 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173939  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3310  periplasmic solute binding protein  85.43 
 
 		 302 aa  543  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0243618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3516  periplasmic solute binding protein  77.78 
 
 		 288 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.996617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4333  periplasmic solute binding protein  74.83 
 
 		 303 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0448  periplasmic solute binding protein  76.57 
 
 		 303 aa  481  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0617  periplasmic solute binding protein  74.5 
 
 		 304 aa  477  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00875081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3715  periplasmic solute binding protein  74.59 
 
 		 307 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000108388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0528  periplasmic solute binding protein  67.22 
 
 		 315 aa  431  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000128694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3141  adhesion protein, putative  72.95 
 
 		 302 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.452459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2538  zinc/manganese transport system substrate-binding protein  51.65 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000605  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  49.45 
 
 		 308 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000153864  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  47.16 
 
 		 298 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06465  hypothetical protein  47.96 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1548  periplasmic solute binding protein  35.49 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000077382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1530  periplasmic solute binding protein  40.08 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1625  periplasmic solute binding protein  42.11 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.624808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3917  periplasmic solute binding protein  37.25 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247464  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2339  ABC metal ion transporter, periplasmic solute binding protein  42.11 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.591821  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0972  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0180469  normal  0.0507696 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1535  periplasmic solute binding protein  42.51 
 
 		 299 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619757 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0051  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.958228  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0490  periplasmic solute binding protein  31 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2435  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0108745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3052  periplasmic solute binding protein  32.84 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  27.11 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  22.64 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  23.72 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  25.27 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  23.36 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  22.88 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.7 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  24.38 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  26.7 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0094  periplasmic solute binding protein  24.55 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000753569  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  19.13 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0400  periplasmic solute binding protein  23.75 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  25.13 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  27.18 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  22.7 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  21.3 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  29.17 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  23.31 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  25.85 
 
 		 365 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  25.81 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  26.48 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  23.53 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  22.09 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  20.4 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  28.17 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  28.21 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  22.62 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000836  cation ABC transporter cation-binding protein  22.49 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  27.78 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  24.89 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  21.95 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  23.62 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  21.54 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  20.17 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.23 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  24.18 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  28.72 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.18 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  23.5 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.72 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.72 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.72 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  22.81 
 
 		 346 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  20.4 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  23.68 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.72 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  26.42 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  28.72 
 
 		 393 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  24.18 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  20.4 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  20.4 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  18.41 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  20.4 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  26.8 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  22.32 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  24.46 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  23.79 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  19.6 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0998  periplasmic solute binding protein  26.72 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0851489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  20 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  19.6 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  23.61 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.28 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  23.5 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  19.2 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  23.32 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.28 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>