268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0537 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3334  beta-lactamase domain-containing protein  86.61 
 
 
478 aa  874    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0541  metallo-beta-lactamase family protein  92.66 
 
 
478 aa  923    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3953  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  90.78 
 
 
480 aa  906    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  73.96 
 
 
481 aa  749    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3232  beta-lactamase domain-containing protein  73.64 
 
 
489 aa  744    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3292  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  74.06 
 
 
490 aa  745    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3827  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  90.99 
 
 
480 aa  908    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3771  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  90.57 
 
 
480 aa  904    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4158  aspartate kinase  79.83 
 
 
478 aa  814    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0539  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase  96.03 
 
 
480 aa  956    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3492  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  96.03 
 
 
480 aa  956    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3602  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  74.11 
 
 
490 aa  763    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000350398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0537  aspartate kinase  100 
 
 
480 aa  993    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0497  metallo-beta-lactamase family protein  73.01 
 
 
484 aa  730    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  53.59 
 
 
476 aa  496  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  51.18 
 
 
465 aa  481  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  52.93 
 
 
463 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  52.83 
 
 
462 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  50.78 
 
 
462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  53.85 
 
 
464 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  51.93 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  49.66 
 
 
465 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.24 
 
 
455 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  47.1 
 
 
470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  46.21 
 
 
469 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.27 
 
 
467 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  46.14 
 
 
468 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.76 
 
 
541 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  44.22 
 
 
467 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.54 
 
 
536 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.97 
 
 
466 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  44 
 
 
467 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1566  beta-lactamase domain protein  42.47 
 
 
531 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.04 
 
 
540 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  45.98 
 
 
467 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  41.85 
 
 
522 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.09 
 
 
466 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.02 
 
 
525 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  40.94 
 
 
525 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  44.47 
 
 
467 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.35 
 
 
543 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.08 
 
 
474 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  40.59 
 
 
570 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0554  beta-lactamase domain-containing protein  42.43 
 
 
464 aa  363  5.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.199142  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.88 
 
 
530 aa  362  9e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1285  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  42.64 
 
 
469 aa  356  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  44.14 
 
 
524 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  40.87 
 
 
547 aa  349  6e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  39.87 
 
 
536 aa  348  8e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  41.16 
 
 
515 aa  349  8e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  43.17 
 
 
471 aa  345  8.999999999999999e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  40.75 
 
 
544 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  40.32 
 
 
464 aa  342  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  40.31 
 
 
536 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  41.1 
 
 
467 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.85 
 
 
470 aa  340  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2679  metallo-beta-lactamase family protein  40.76 
 
 
462 aa  340  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.947149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2304  beta-lactamase domain protein  40.76 
 
 
462 aa  340  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  38 
 
 
535 aa  339  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.59 
 
 
465 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  40.36 
 
 
536 aa  336  7e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  40.86 
 
 
468 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  41.5 
 
 
464 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  39.78 
 
 
468 aa  332  9e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  38.24 
 
 
465 aa  330  3e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  40.82 
 
 
465 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  40.62 
 
 
535 aa  324  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  38.16 
 
 
464 aa  322  9.999999999999999e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  40.04 
 
 
469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1341  beta-lactamase domain protein  40.86 
 
 
465 aa  312  6.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  40.76 
 
 
460 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  37.02 
 
 
451 aa  310  5e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.18 
 
 
452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  40.31 
 
 
460 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.09 
 
 
460 aa  306  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  41.97 
 
 
453 aa  306  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2452  beta-lactamase domain-containing protein  37.78 
 
 
547 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.654056  normal  0.754885 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  39.91 
 
 
470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  38.12 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  38.99 
 
 
455 aa  303  5.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  39.47 
 
 
452 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  39.69 
 
 
452 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  39.06 
 
 
468 aa  300  5e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  39.33 
 
 
455 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  40.41 
 
 
452 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  38.53 
 
 
461 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  39.56 
 
 
452 aa  297  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  38.56 
 
 
476 aa  292  9e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0156  beta-lactamase-like protein  39.82 
 
 
485 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215691  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1444  metallo-beta-lactamase family protein  35.34 
 
 
470 aa  290  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  39.16 
 
 
470 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  38.9 
 
 
455 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  39.12 
 
 
455 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  38.65 
 
 
453 aa  289  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  38.48 
 
 
472 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  39.16 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  39.47 
 
 
452 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 
454 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  40.09 
 
 
454 aa  286  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  38.7 
 
 
452 aa  285  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>