271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0520 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 
136 aa  264  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  99.26 
 
 
136 aa  263  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3511  large-conductance mechanosensitive channel  99.26 
 
 
136 aa  263  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3339  large-conductance mechanosensitive channel  94.85 
 
 
136 aa  257  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0554  large-conductance mechanosensitive channel  94.85 
 
 
136 aa  254  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000110723  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0522  large-conductance mechanosensitive channel  95.59 
 
 
136 aa  253  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  95.59 
 
 
136 aa  253  9e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  95.59 
 
 
136 aa  253  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  95.59 
 
 
136 aa  253  9e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  95.59 
 
 
136 aa  253  9e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  72.79 
 
 
137 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  72.79 
 
 
137 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  71.32 
 
 
154 aa  207  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  72.93 
 
 
136 aa  207  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  71.64 
 
 
148 aa  204  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  69.12 
 
 
139 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  69.12 
 
 
139 aa  204  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  69.12 
 
 
139 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  70.37 
 
 
148 aa  201  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  64.71 
 
 
137 aa  190  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0793  large-conductance mechanosensitive channel  72.79 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  63.97 
 
 
137 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  64.71 
 
 
136 aa  184  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  64.71 
 
 
136 aa  184  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  64.71 
 
 
136 aa  184  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  64.71 
 
 
136 aa  184  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  64.71 
 
 
136 aa  184  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  64.71 
 
 
136 aa  184  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  64.71 
 
 
136 aa  184  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  64.71 
 
 
136 aa  184  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  64.71 
 
 
136 aa  184  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  61.76 
 
 
137 aa  184  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  64.18 
 
 
133 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  63.5 
 
 
137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  63.5 
 
 
137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  63.16 
 
 
141 aa  178  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  63.43 
 
 
134 aa  176  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  61.65 
 
 
134 aa  173  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  62.6 
 
 
132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  66.67 
 
 
135 aa  170  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  57.89 
 
 
135 aa  169  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  65.67 
 
 
134 aa  167  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4515  large-conductance mechanosensitive channel  66.67 
 
 
138 aa  167  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00658327  hitchhiker  0.00000531483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1256  large conductance mechanosensitive channel protein  66.91 
 
 
136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00104806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  64.39 
 
 
133 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  61.31 
 
 
143 aa  158  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3679  large-conductance mechanosensitive channel  63.24 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3607  large-conductance mechanosensitive channel  63.24 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.256612 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3606  large-conductance mechanosensitive channel  63.24 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0494582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3714  large-conductance mechanosensitive channel  63.24 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.401904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3777  large-conductance mechanosensitive channel  63.24 
 
 
137 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  58.02 
 
 
131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  58.02 
 
 
132 aa  149  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  55.15 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  56.06 
 
 
126 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  52.9 
 
 
139 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  54.55 
 
 
144 aa  140  8e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1549  large-conductance mechanosensitive channel  62.69 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.406526  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  53.19 
 
 
140 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1330  large conductance mechanosensitive channel protein  58.52 
 
 
139 aa  137  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
138 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  53.9 
 
 
139 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2194  large conductance mechanosensitive channel protein  56.59 
 
 
129 aa  135  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.166081  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1655  large conductance mechanosensitive channel protein  55.74 
 
 
123 aa  133  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  52.45 
 
 
143 aa  133  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0386  large conductance mechanosensitive channel protein  52.45 
 
 
143 aa  133  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.242536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  49.65 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  47.79 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  56.72 
 
 
133 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  54.14 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  49.65 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  54.89 
 
 
145 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  48.94 
 
 
151 aa  130  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 
132 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 
132 aa  130  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 
132 aa  130  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  57.14 
 
 
132 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  47.45 
 
 
143 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1425  large conductance mechanosensitive channel protein  53.44 
 
 
137 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  50.74 
 
 
127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  47.06 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  53.73 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  53.57 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  55.88 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  56.39 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  54.48 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  51.75 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  51.75 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  47.86 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  47.86 
 
 
141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal 
 
 
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NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  48.57 
 
 
138 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  54.89 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2261  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  47.45 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.153997 
 
 
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NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  54.48 
 
 
132 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_2603  large-conductance mechanosensitive channel  50.36 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.240683  normal 
 
 
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NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  48.2 
 
 
137 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
138 aa  124  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
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NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 
138 aa  123  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
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