210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0334 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 
144 aa  303  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  98.61 
 
 
144 aa  298  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  97.92 
 
 
144 aa  298  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  93.75 
 
 
144 aa  292  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  86.81 
 
 
144 aa  271  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  88.03 
 
 
143 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  88.03 
 
 
143 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  88.03 
 
 
143 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  87.32 
 
 
143 aa  266  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  76.81 
 
 
144 aa  234  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  72.03 
 
 
143 aa  233  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  71.33 
 
 
159 aa  229  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  68.75 
 
 
149 aa  228  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  69.93 
 
 
154 aa  224  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  73.19 
 
 
143 aa  222  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  51.85 
 
 
138 aa  170  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  55.73 
 
 
140 aa  170  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 
140 aa  169  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 
143 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  54.26 
 
 
149 aa  166  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  53.38 
 
 
143 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 
142 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  53.49 
 
 
141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 
141 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  54.84 
 
 
143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  49.62 
 
 
144 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  46.97 
 
 
135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 
140 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  48.46 
 
 
142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  45.32 
 
 
139 aa  149  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  47.69 
 
 
142 aa  147  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  49.23 
 
 
148 aa  143  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  48.09 
 
 
152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
144 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
144 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  47.66 
 
 
143 aa  141  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  47.2 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  41.04 
 
 
144 aa  117  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
150 aa  116  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  24.43 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  31.45 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.59 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  28.35 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
146 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.91 
 
 
115 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  31.08 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
139 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  29.81 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  21.48 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.39 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
141 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  30.59 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4077  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3609  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  27.78 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  23.36 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2090  hypothetical protein  25.21 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000228869  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  29.41 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  29.41 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 
127 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  22.77 
 
 
130 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.17 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  21.97 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  23.64 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0332  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.43 
 
 
159 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  23.29 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>