More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0302 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  91.34 
 
 		 335 aa  630  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  90.15 
 
 		 335 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000628  putative transcription regulator  58.91 
 
 		 333 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0267  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  37.8 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 375 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 337 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  25.38 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  25.85 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 340 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 335 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 365 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  25.22 
 
 		 358 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  25.22 
 
 		 358 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  24.48 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 376 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  26.28 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  23.71 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  23.93 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  29.1 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  25.8 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  25.46 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  26.83 
 
 		 337 aa  99.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  24.78 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  24.68 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  24.54 
 
 		 390 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 367 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 334 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3048  AraC family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 342 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.428431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1288  transcriptional regulator, AraC family  22.94 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0045  helix-turn-helix domain-containing protein  22.94 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  25.4 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  26.41 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  26 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 353 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  23.01 
 
 		 352 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  25.5 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  24.92 
 
 		 345 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  25.68 
 
 		 337 aa  85.9  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  25.36 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0593  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  25.38 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  25.76 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1176  AraC family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5495  AraC/XylS family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143439  normal  0.457572 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5098  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  28.22 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  25.15 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>