More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0280 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  89.1 
 
 		 367 aa  682    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  91.01 
 
 		 367 aa  696    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  96.46 
 
 		 367 aa  729    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  91.28 
 
 		 367 aa  698    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  90.74 
 
 		 367 aa  692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  91.28 
 
 		 367 aa  696    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  96.46 
 
 		 367 aa  731    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  97 
 
 		 367 aa  734    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  100 
 
 		 367 aa  754    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  76.29 
 
 		 368 aa  586  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  74.93 
 
 		 369 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4786  ABC transporter related  73.57 
 
 		 368 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00107272  hitchhiker  0.000000252906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  72.48 
 
 		 369 aa  559  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  70.91 
 
 		 373 aa  524  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  68.14 
 
 		 370 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  49.29 
 
 		 375 aa  309  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1393  ABC transporter related  43.13 
 
 		 350 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1923  ABC transporter related  41.78 
 
 		 374 aa  258  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  40.51 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  37.89 
 
 		 383 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  33.52 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1455  ABC transporter related  33.52 
 
 		 380 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1209  ABC transporter related  33.81 
 
 		 380 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1556  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0835  ABC transporter related  45.06 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  43.32 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  39.08 
 
 		 370 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  37.72 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 333 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.71 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  42.86 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  40.08 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  42.91 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 366 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  42.91 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  37.58 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  45.81 
 
 		 343 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  43.96 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.7 
 
 		 356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2038  ABC transporter related  44.35 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  38.58 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 353 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  37.89 
 
 		 366 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  42.45 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  33.71 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4252  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.51 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  45.22 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.62 
 
 		 375 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2499  ABC transporter related  39.42 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.89 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  44.54 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  45.69 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.26 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 354 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  43.04 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.99 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.22 
 
 		 345 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 		 375 aa  180  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.26 
 
 		 378 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 367 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 		 375 aa  180  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.8 
 
 		 354 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.28 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  35.28 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3462  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  45.37 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  0.0690127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.28 
 
 		 343 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  43.36 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  43.69 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.98 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0256  ABC transporter related  41.85 
 
 		 367 aa  179  7e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  33.52 
 
 		 366 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.39 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 		 355 aa  179  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.89 
 
 		 338 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 		 354 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  41.74 
 
 		 386 aa  179  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  43.05 
 
 		 348 aa  179  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  44.89 
 
 		 329 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  44.89 
 
 		 329 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.89 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  45.31 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.87 
 
 		 373 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>