More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0124 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  55.7 
 
 
938 aa  915    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  79.16 
 
 
935 aa  1392    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  56.48 
 
 
945 aa  923    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  87.98 
 
 
936 aa  1505    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  74.59 
 
 
865 aa  1311    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  73.16 
 
 
871 aa  1268    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  73.84 
 
 
867 aa  1303    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  57.36 
 
 
965 aa  936    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  53.74 
 
 
938 aa  853    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  72.93 
 
 
871 aa  1268    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  76.63 
 
 
869 aa  1317    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  56.29 
 
 
865 aa  949    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  57.18 
 
 
951 aa  885    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  59.06 
 
 
951 aa  944    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  100 
 
 
856 aa  1754    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  87.74 
 
 
936 aa  1501    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  39.14 
 
 
918 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  35.65 
 
 
751 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  32.95 
 
 
796 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  32.78 
 
 
795 aa  369  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  33.2 
 
 
795 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  32.69 
 
 
796 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.77 
 
 
795 aa  365  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.69 
 
 
796 aa  364  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.82 
 
 
795 aa  363  6e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  32.82 
 
 
795 aa  360  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.82 
 
 
795 aa  360  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  32.82 
 
 
795 aa  360  6e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  32.82 
 
 
795 aa  360  6e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  33.33 
 
 
812 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  32.69 
 
 
799 aa  357  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  33.46 
 
 
794 aa  357  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  32.68 
 
 
794 aa  357  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  32.57 
 
 
799 aa  356  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  32.99 
 
 
799 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  32.69 
 
 
799 aa  355  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  32.69 
 
 
799 aa  355  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  32.99 
 
 
799 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  32.57 
 
 
799 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  32.44 
 
 
799 aa  352  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  32.95 
 
 
795 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  32.44 
 
 
799 aa  351  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  32.82 
 
 
795 aa  350  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  32.32 
 
 
796 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  32.9 
 
 
795 aa  333  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  32.44 
 
 
763 aa  232  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  32.38 
 
 
763 aa  230  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  29.97 
 
 
770 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  31.56 
 
 
764 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  27.59 
 
 
781 aa  211  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.63 
 
 
1045 aa  207  6e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  31.35 
 
 
746 aa  204  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.16 
 
 
927 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  29.21 
 
 
771 aa  200  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  29.46 
 
 
760 aa  196  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.61 
 
 
744 aa  187  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  24.89 
 
 
924 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  28.57 
 
 
768 aa  174  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  27.79 
 
 
806 aa  171  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  25.77 
 
 
811 aa  152  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  26.33 
 
 
747 aa  152  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  25.49 
 
 
825 aa  140  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  31.6 
 
 
566 aa  97.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  29.17 
 
 
513 aa  82.8  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.84 
 
 
699 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3183  M6 family peptidase  26.95 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.585369  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 
1158 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  45.36 
 
 
918 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  47.37 
 
 
852 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  49.41 
 
 
2066 aa  66.6  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  59.18 
 
 
960 aa  65.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  59.18 
 
 
960 aa  65.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  37.62 
 
 
1194 aa  66.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.26 
 
 
945 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  42.11 
 
 
773 aa  65.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  44.05 
 
 
677 aa  65.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  51.25 
 
 
1150 aa  64.7  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  56 
 
 
960 aa  64.7  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  42.53 
 
 
840 aa  64.7  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  57.14 
 
 
967 aa  64.7  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  46.25 
 
 
487 aa  64.3  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  48.72 
 
 
818 aa  63.9  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  43.01 
 
 
778 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.62 
 
 
953 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  43.01 
 
 
778 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  42.7 
 
 
792 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.86 
 
 
836 aa  63.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  41.38 
 
 
1167 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  43.68 
 
 
930 aa  63.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  43.01 
 
 
778 aa  63.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  40.86 
 
 
820 aa  63.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  35.59 
 
 
816 aa  62.4  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  39.58 
 
 
787 aa  62.4  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  46.51 
 
 
1565 aa  62  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  27.89 
 
 
633 aa  61.6  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  41.94 
 
 
778 aa  61.2  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  54.93 
 
 
1667 aa  61.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  24.08 
 
 
811 aa  60.5  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4679  PKD domain-containing protein  23.65 
 
 
1367 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  44.16 
 
 
3197 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>