More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0099 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0099  histidine utilization repressor  100 
 
 
235 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0093  histidine utilization repressor  99.57 
 
 
235 aa  483  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0098  histidine utilization repressor  99.15 
 
 
235 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0096  histidine utilization repressor  97.45 
 
 
235 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  86.81 
 
 
235 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0078  histidine utilization repressor  86.81 
 
 
235 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0096  GntR family transcriptional regulator  86.81 
 
 
235 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4253  histidine utilization repressor  86.38 
 
 
235 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3758  histidine utilization repressor  78.72 
 
 
235 aa  387  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3954  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  78.3 
 
 
247 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4448  histidine utilization repressor  78.11 
 
 
233 aa  387  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  77.78 
 
 
234 aa  378  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4839  histidine utilization repressor  78.11 
 
 
233 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  75.21 
 
 
234 aa  362  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  72.77 
 
 
235 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  58.95 
 
 
245 aa  277  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1020  histidine utilization repressor  52.59 
 
 
244 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  51.33 
 
 
251 aa  238  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03128  histidine utilization repressor  48.36 
 
 
246 aa  237  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  52.4 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  52.4 
 
 
248 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  52.4 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  49.35 
 
 
231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  52.4 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  48.92 
 
 
231 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  48.92 
 
 
231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  48.92 
 
 
231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  50.66 
 
 
273 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  48.05 
 
 
231 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  51.09 
 
 
250 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  48.05 
 
 
231 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  50.66 
 
 
250 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  50.22 
 
 
249 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  47.62 
 
 
231 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  50.44 
 
 
249 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  47.84 
 
 
251 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  50.88 
 
 
247 aa  225  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  50 
 
 
251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  49.34 
 
 
244 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  49.56 
 
 
251 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3905  GntR family transcriptional regulator  46.93 
 
 
255 aa  222  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
247 aa  220  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  47.62 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  45.45 
 
 
231 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  45.89 
 
 
231 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  44.2 
 
 
234 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  45.89 
 
 
231 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  45.89 
 
 
231 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0826  histidine utilization repressor  45.96 
 
 
236 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000366249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  46.32 
 
 
231 aa  218  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  47.62 
 
 
231 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 
255 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  46.32 
 
 
231 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  45.13 
 
 
255 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  47.41 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  45.45 
 
 
231 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  47.77 
 
 
252 aa  215  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2210  histidine utilization repressor  45.45 
 
 
231 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  46.02 
 
 
301 aa  215  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  46.32 
 
 
231 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  46.32 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  46.32 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  46.32 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  46.32 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  46.32 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  46.32 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  46.75 
 
 
234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  46.98 
 
 
255 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  46.98 
 
 
255 aa  212  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003719  histidine utilization repressor  44.21 
 
 
235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.746481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  48.71 
 
 
251 aa  211  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  43.36 
 
 
245 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  41.15 
 
 
234 aa  209  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2882  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  44.74 
 
 
237 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  45.85 
 
 
251 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2476  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  44.74 
 
 
237 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00699876  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
250 aa  204  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2648  histidine utilization repressor transcription regulator protein  44.49 
 
 
237 aa  203  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186467  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  43.35 
 
 
235 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  46.05 
 
 
241 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  42.92 
 
 
260 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  44.64 
 
 
267 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  46.05 
 
 
241 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  46.05 
 
 
241 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  44.64 
 
 
267 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  46.05 
 
 
241 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5835  histidine utilization repressor  45.89 
 
 
251 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.926396  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5618  histidine utilization repressor  45.89 
 
 
251 aa  201  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214724 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0853  histidine utilization repressor  46.05 
 
 
241 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4559  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  44.59 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  44.83 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  44.83 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  45.41 
 
 
245 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  43.72 
 
 
245 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4839  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  45.45 
 
 
253 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  43.97 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  44.98 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  43.97 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6110  histidine utilization repressor  44.59 
 
 
251 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5746  histidine utilization repressor  44.59 
 
 
251 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>