64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0084 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  98.85 
 
 
87 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  96.55 
 
 
87 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  87.36 
 
 
88 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  79.31 
 
 
88 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  78.16 
 
 
88 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  77.01 
 
 
87 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  77.01 
 
 
87 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  64.94 
 
 
108 aa  114  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  64.94 
 
 
82 aa  105  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  59.49 
 
 
85 aa  104  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  55.7 
 
 
81 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  61.84 
 
 
79 aa  99  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  53.75 
 
 
85 aa  88.2  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  39.74 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  39.74 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  40.96 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  37.5 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  38.64 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  38.27 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  37.5 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  38.46 
 
 
115 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  37.97 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  31.17 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  35.9 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  33.77 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  28.24 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  31.08 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  34.62 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  38.96 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  34.21 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  33.72 
 
 
96 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  32.14 
 
 
96 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  25.58 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  33.77 
 
 
98 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  35.44 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  32.89 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  31.58 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  29.87 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  31.71 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  35.06 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  30.77 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  30.95 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  28.21 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  31.08 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  39.71 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  29.73 
 
 
87 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  35.16 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  27.16 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  29.27 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2596  hypothetical protein  31.25 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2544  acetyltransferase-like protein  31.25 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0495517  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  27.85 
 
 
94 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  36.71 
 
 
99 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  29.73 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  30.26 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  31.08 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  31.51 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>