37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0081 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  90.95 
 
 
828 aa  1580    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  73.44 
 
 
816 aa  1290    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  73.68 
 
 
816 aa  1296    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  97.83 
 
 
829 aa  1688    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3001  MORN repeat-containing protein  58.41 
 
 
684 aa  793    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.972797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  96.98 
 
 
829 aa  1679    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  73.47 
 
 
818 aa  1297    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  100 
 
 
829 aa  1721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  73.8 
 
 
816 aa  1292    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  25.23 
 
 
769 aa  87.8  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  25.4 
 
 
770 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  24.77 
 
 
769 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  26.8 
 
 
770 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  26.2 
 
 
769 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  26.12 
 
 
770 aa  82  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  26.8 
 
 
770 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  26.8 
 
 
770 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  26.33 
 
 
772 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  27.54 
 
 
770 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0343  hypothetical protein  22.57 
 
 
429 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  22.67 
 
 
768 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  25.41 
 
 
454 aa  52.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  25.94 
 
 
291 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  25.65 
 
 
566 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  27.04 
 
 
449 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  23.08 
 
 
580 aa  48.9  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  33.33 
 
 
566 aa  48.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  21.63 
 
 
300 aa  47.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  25.28 
 
 
566 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  25.81 
 
 
566 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  25 
 
 
566 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  25 
 
 
566 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  25.5 
 
 
566 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  38.24 
 
 
691 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  27.42 
 
 
571 aa  44.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  24.9 
 
 
332 aa  44.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  24.41 
 
 
534 aa  44.3  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>