15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0079 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0074  hypothetical protein  78.9 
 
 
435 aa  666    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0077  hypothetical protein  99.77 
 
 
436 aa  849    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0075  hypothetical protein  99.54 
 
 
436 aa  847    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0079  hypothetical protein  100 
 
 
436 aa  850    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4275  hypothetical protein  61.66 
 
 
436 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0074  hypothetical protein  61.43 
 
 
436 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0079  hypothetical protein  61.89 
 
 
436 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0076  hypothetical protein  61.2 
 
 
436 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0060  hypothetical protein  59.73 
 
 
438 aa  487  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3974  hypothetical protein  43.58 
 
 
430 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3777  hypothetical protein  41.95 
 
 
420 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4861  hypothetical protein  39.81 
 
 
428 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4187  hypothetical protein  38.86 
 
 
434 aa  263  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0071  hypothetical protein  32.3 
 
 
438 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3572  hypothetical protein  30.94 
 
 
413 aa  130  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>