238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0076 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  63.85 
 
 		 527 aa  658    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  88.68 
 
 		 539 aa  1002    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  64.88 
 
 		 519 aa  663    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  76.33 
 
 		 549 aa  879    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  60.75 
 
 		 533 aa  658    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  77.64 
 
 		 545 aa  886    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  95.36 
 
 		 535 aa  1049    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  95.73 
 
 		 535 aa  1077    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  60.08 
 
 		 532 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  100 
 
 		 539 aa  1128    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  78.36 
 
 		 540 aa  885    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  63.83 
 
 		 517 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  74.2 
 
 		 546 aa  823    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  78.43 
 
 		 538 aa  887    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  62.18 
 
 		 521 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  57.26 
 
 		 507 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  36.13 
 
 		 480 aa  333  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  35.54 
 
 		 533 aa  246  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  33.41 
 
 		 508 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  31.42 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  31.57 
 
 		 513 aa  219  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  34.42 
 
 		 502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  28.42 
 
 		 688 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  32 
 
 		 670 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  30.77 
 
 		 669 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  27.7 
 
 		 693 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.08 
 
 		 645 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  26.25 
 
 		 475 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  27.9 
 
 		 476 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  31.47 
 
 		 656 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  24.82 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 		 675 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  26.48 
 
 		 495 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  26.61 
 
 		 680 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  25.87 
 
 		 668 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  29.2 
 
 		 740 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  23.58 
 
 		 480 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 503 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  24.95 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  25.73 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  25.85 
 
 		 533 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  25.85 
 
 		 508 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  25.85 
 
 		 508 aa  104  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  26.09 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  22.96 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 		 477 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  24.68 
 
 		 485 aa  97.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  24.89 
 
 		 522 aa  97.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  27.16 
 
 		 564 aa  97.1  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  23.28 
 
 		 489 aa  96.7  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  24.41 
 
 		 520 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  28.14 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  23.47 
 
 		 511 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  23.47 
 
 		 511 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  23.47 
 
 		 511 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  23.52 
 
 		 518 aa  92.8  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 505 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  24.39 
 
 		 547 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  27.72 
 
 		 504 aa  91.3  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  24.57 
 
 		 523 aa  90.9  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  25.75 
 
 		 494 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  23.63 
 
 		 612 aa  90.9  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  26.8 
 
 		 505 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  24.35 
 
 		 508 aa  90.5  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  25.08 
 
 		 546 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  23.84 
 
 		 524 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 506 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  25 
 
 		 527 aa  88.6  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  32.21 
 
 		 545 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  24.53 
 
 		 500 aa  87.4  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.64 
 
 		 505 aa  87.8  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  24.15 
 
 		 571 aa  87.4  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  25.5 
 
 		 750 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  24.12 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  23.81 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  26.1 
 
 		 515 aa  84  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  23.99 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  24.94 
 
 		 540 aa  83.6  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  24.27 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  25.5 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  27.92 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  23.65 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  21.74 
 
 		 542 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  25.94 
 
 		 525 aa  81.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  22.37 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  24.52 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  26.62 
 
 		 643 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  23.5 
 
 		 532 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  28.14 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  23.28 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  26.61 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  27.43 
 
 		 300 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  26.91 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  24.29 
 
 		 535 aa  79.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  28.8 
 
 		 556 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  26.72 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  23.19 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  25.34 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  26.87 
 
 		 542 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  24.17 
 
 		 538 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>