17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0056 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0653  hypothetical protein  26.21 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.395081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1885  hypothetical protein  22.95 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  23.59 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  22.26 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  24.41 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  26.21 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  25.37 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1649  hypothetical protein  25.56 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.432038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0240  hypothetical protein  25.09 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0261  hypothetical protein  23.93 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0963  hypothetical protein  20.45 
 
 		 365 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2823  hypothetical protein  24.76 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2563  hypothetical protein  23.15 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0027  hypothetical protein  23.43 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02980  hypothetical protein  20.69 
 
 		 330 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0028  w0044  40 
 
 		 66 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>