More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3841 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  54.43 
 
 		 706 aa  773    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  73.09 
 
 		 690 aa  1050    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  62.03 
 
 		 697 aa  919    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 712 aa  1464    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  72.25 
 
 		 702 aa  1048    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  83.78 
 
 		 710 aa  1252    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  71.41 
 
 		 701 aa  1041    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  72.25 
 
 		 706 aa  1068    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  81.59 
 
 		 714 aa  1211    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  73.01 
 
 		 709 aa  1066    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  72.87 
 
 		 709 aa  1061    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  71.89 
 
 		 697 aa  1046    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  83.75 
 
 		 712 aa  1226    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  71.97 
 
 		 706 aa  1062    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  72.25 
 
 		 706 aa  1068    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  71.55 
 
 		 703 aa  1051    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  45.36 
 
 		 690 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  44.16 
 
 		 699 aa  554  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  42.43 
 
 		 693 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  40.22 
 
 		 693 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 770 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 710 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 710 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  28.33 
 
 		 860 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 		 850 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 		 749 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.79 
 
 		 708 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 719 aa  213  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  28.83 
 
 		 711 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 748 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  29.9 
 
 		 748 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 		 708 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.24 
 
 		 709 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  29.57 
 
 		 737 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 740 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 708 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 743 aa  207  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 738 aa  207  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 		 742 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 		 742 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.74 
 
 		 703 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 710 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 706 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 706 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.23 
 
 		 711 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 715 aa  201  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 		 726 aa  200  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 707 aa  200  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 721 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 712 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 689 aa  198  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 796 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 710 aa  197  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.4 
 
 		 724 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0802  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 		 764 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 731 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 694 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 743 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  27.61 
 
 		 743 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 743 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  27.21 
 
 		 796 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 796 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 751 aa  194  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 738 aa  193  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 796 aa  193  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 743 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 743 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 733 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 743 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 743 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 724 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 734 aa  191  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 747 aa  191  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 729 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  27.95 
 
 		 689 aa  190  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  27.25 
 
 		 751 aa  190  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 710 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 726 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  26.6 
 
 		 726 aa  190  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 825 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 825 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 710 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.09 
 
 		 713 aa  188  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 707 aa  188  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 		 701 aa  188  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 732 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 712 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 749 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 843 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 815 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 859 aa  187  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 742 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  25.6 
 
 		 742 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.96 
 
 		 713 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 732 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 792 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 714 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 817 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 862 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 741 aa  185  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>