More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3805 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 170 aa  351  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  84.03 
 
 		 144 aa  258  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  82.64 
 
 		 144 aa  254  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  77.08 
 
 		 144 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  73.61 
 
 		 144 aa  236  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  74.31 
 
 		 144 aa  234  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  72.97 
 
 		 158 aa  234  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  73.61 
 
 		 144 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  72.92 
 
 		 144 aa  231  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  71.53 
 
 		 144 aa  227  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  68.75 
 
 		 144 aa  221  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  70.95 
 
 		 149 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  70.95 
 
 		 149 aa  214  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  70.95 
 
 		 149 aa  213  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  72.22 
 
 		 144 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  65.89 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  50.69 
 
 		 144 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  50.35 
 
 		 144 aa  155  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  50.35 
 
 		 144 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  50.35 
 
 		 144 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  49.65 
 
 		 144 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  48.95 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  45.83 
 
 		 144 aa  144  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  45.83 
 
 		 144 aa  143  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  47.55 
 
 		 143 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  46.85 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  46.15 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  46.85 
 
 		 143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  47.52 
 
 		 142 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  45.45 
 
 		 143 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 143 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  45.45 
 
 		 143 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 143 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 143 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 143 aa  138  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 143 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 143 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  44.76 
 
 		 143 aa  137  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  42.57 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 		 141 aa  130  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  43.57 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0174  rhodanese domain-containing protein  39.16 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  44.68 
 
 		 141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  43.26 
 
 		 141 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  43.55 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  39.86 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 138 aa  104  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  39.16 
 
 		 145 aa  97.8  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  39.13 
 
 		 138 aa  96.3  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  34.04 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  38.52 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  38.52 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  37.06 
 
 		 144 aa  95.5  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 141 aa  94  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  36.62 
 
 		 141 aa  93.6  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  41.58 
 
 		 141 aa  93.2  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  44.33 
 
 		 140 aa  91.7  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  91.3  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.75 
 
 		 141 aa  90.9  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 		 151 aa  90.9  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  41.6 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  28.37 
 
 		 142 aa  88.2  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  33.57 
 
 		 146 aa  87.4  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  32.88 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  40.2 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  36.75 
 
 		 123 aa  86.3  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  33.09 
 
 		 135 aa  85.5  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 138 aa  84.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 		 140 aa  84.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  37.8 
 
 		 141 aa  84  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  41.35 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  34.78 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  38.78 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  38.78 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  38.46 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  39.42 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  39.42 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  38.14 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  32.12 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  37.25 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>