17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3783 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3783  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4868  hypothetical protein  41.03 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3980  hypothetical protein  41.03 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0054  hypothetical protein  40.24 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.541214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0070  hypothetical protein  34.15 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4281  hypothetical protein  34.15 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0068  hypothetical protein  34.15 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0068  hypothetical protein  35.37 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0073  hypothetical protein  34.15 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0071  hypothetical protein  40.28 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0913399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0073  hypothetical protein  40.28 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000535971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0069  hypothetical protein  40.28 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.25359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4193  hypothetical protein  36.49 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0327029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0065  hypothetical protein  40.51 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3578  hypothetical protein  35.9 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0912  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01392  hypothetical protein  51.28 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>