298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3772 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 142 aa  299  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  75.18 
 
 		 150 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  76.26 
 
 		 150 aa  230  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  75.18 
 
 		 146 aa  230  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  75.18 
 
 		 142 aa  230  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  76.98 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  76.26 
 
 		 154 aa  228  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  74.65 
 
 		 150 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  74.82 
 
 		 142 aa  225  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  75.54 
 
 		 154 aa  224  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  66.91 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  69.29 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  63.31 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  66.19 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  65.47 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  59.71 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  57.36 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  53.03 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  52.31 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  40.46 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  38.1 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  41.23 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  29.69 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  34.71 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04590  conserved hypothetical protein  29.01 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  32.17 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  28.06 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  32.17 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  28.8 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  26.15 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  27.42 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  28.46 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  27.48 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  25 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  27.91 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  29.03 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03599  conserved hypothetical protein  31.47 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  27.69 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  23.7 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>