245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3740 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  82.71 
 
 		 480 aa  750    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  86.25 
 
 		 480 aa  835    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  82.5 
 
 		 480 aa  797    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  83.75 
 
 		 480 aa  810    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  86.67 
 
 		 480 aa  835    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  83.12 
 
 		 480 aa  799    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  83.33 
 
 		 480 aa  800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  75.42 
 
 		 480 aa  743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  83.33 
 
 		 480 aa  801    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000304543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  83.12 
 
 		 480 aa  797    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  0.00000165872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  79.38 
 
 		 480 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  83.33 
 
 		 480 aa  801    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  83.33 
 
 		 480 aa  801    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 		 480 aa  972    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  83.33 
 
 		 480 aa  801    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  58.84 
 
 		 481 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  58.13 
 
 		 481 aa  561  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  57.71 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  56.9 
 
 		 481 aa  513  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  54.08 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  53.03 
 
 		 483 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  53.75 
 
 		 484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  53.8 
 
 		 484 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  52.53 
 
 		 484 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  52.82 
 
 		 484 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  53.24 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  50.32 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  51.47 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  51.24 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  51.69 
 
 		 484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  49.14 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  50 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  50 
 
 		 484 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  49.14 
 
 		 484 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  50.79 
 
 		 484 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  47.32 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  48.73 
 
 		 490 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000455151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  47.92 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  41.46 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  40.7 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  47.79 
 
 		 493 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  39.96 
 
 		 482 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  44.07 
 
 		 498 aa  363  3e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  39.92 
 
 		 485 aa  352  7e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  40.3 
 
 		 466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  43.45 
 
 		 498 aa  339  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  40.87 
 
 		 500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  40.76 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  38.17 
 
 		 482 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  41.81 
 
 		 466 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  36.04 
 
 		 478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  36.42 
 
 		 481 aa  310  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.36 
 
 		 482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  36.36 
 
 		 482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.98 
 
 		 483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  38.7 
 
 		 510 aa  302  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  36.01 
 
 		 484 aa  302  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  39.01 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  34.72 
 
 		 479 aa  300  5e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  36.55 
 
 		 484 aa  299  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  36.29 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.45 
 
 		 494 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.71 
 
 		 482 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  37.03 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  36.02 
 
 		 484 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  37.86 
 
 		 484 aa  292  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.94 
 
 		 483 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  36.4 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.4 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  37 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  35.85 
 
 		 479 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  36.31 
 
 		 483 aa  282  7.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  35.22 
 
 		 498 aa  282  9e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  38.01 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  35.42 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  38.84 
 
 		 485 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.15 
 
 		 483 aa  280  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  35.19 
 
 		 491 aa  279  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.43 
 
 		 481 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  35.62 
 
 		 476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.77 
 
 		 483 aa  272  8.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  35.79 
 
 		 485 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  37.88 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  35.64 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  35.52 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  36.88 
 
 		 482 aa  270  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  34.7 
 
 		 466 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  36.27 
 
 		 485 aa  269  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  34.02 
 
 		 485 aa  269  8.999999999999999e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.25 
 
 		 482 aa  269  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  35.66 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  34.7 
 
 		 483 aa  269  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  37.25 
 
 		 484 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  32.64 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  36.51 
 
 		 477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  34.09 
 
 		 498 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  33.74 
 
 		 483 aa  266  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  35.04 
 
 		 485 aa  266  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  34.26 
 
 		 483 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  33.91 
 
 		 482 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>