More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3725 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  100 
 
 		 185 aa  376  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  82.58 
 
 		 182 aa  314  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  82.58 
 
 		 182 aa  312  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  82.58 
 
 		 182 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  80.34 
 
 		 184 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  79.78 
 
 		 182 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  79.78 
 
 		 182 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  80.9 
 
 		 182 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  79.78 
 
 		 182 aa  308  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  79.23 
 
 		 182 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  78.69 
 
 		 182 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  78.09 
 
 		 182 aa  299  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  78.09 
 
 		 185 aa  300  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  79.44 
 
 		 180 aa  293  7e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  74.16 
 
 		 184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  72.38 
 
 		 181 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  64.8 
 
 		 180 aa  260  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  66.29 
 
 		 177 aa  255  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  65.54 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  64.04 
 
 		 184 aa  251  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  65.14 
 
 		 183 aa  249  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  62.22 
 
 		 182 aa  245  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  61.02 
 
 		 182 aa  240  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  60.23 
 
 		 182 aa  240  9e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  61.24 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  60.11 
 
 		 181 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000367586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  57.07 
 
 		 184 aa  231  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  57.63 
 
 		 181 aa  230  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  57.3 
 
 		 178 aa  230  9e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  59.43 
 
 		 192 aa  229  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  60.67 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  59.78 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  59.78 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  59.78 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  57.3 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  55.93 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  56 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  54.55 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  57.87 
 
 		 178 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  58.86 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  53.26 
 
 		 293 aa  224  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  53.26 
 
 		 256 aa  223  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  54.29 
 
 		 179 aa  223  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  53.26 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  53.26 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  53.26 
 
 		 256 aa  223  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  53.26 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  56.57 
 
 		 180 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  52.72 
 
 		 184 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  52.72 
 
 		 184 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  52.72 
 
 		 184 aa  219  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  55.56 
 
 		 181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  54.49 
 
 		 185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  53.98 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  52.27 
 
 		 182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  52.27 
 
 		 182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  52.27 
 
 		 182 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  55.81 
 
 		 180 aa  208  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  51.69 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  51.43 
 
 		 179 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  52.63 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  55.56 
 
 		 176 aa  195  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  49.43 
 
 		 178 aa  188  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  50.58 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  49.43 
 
 		 174 aa  187  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  48.86 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  53.25 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3842  transferase  51.74 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  47.95 
 
 		 176 aa  181  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  50 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03943  transferase  49.42 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  50.88 
 
 		 175 aa  177  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  43.86 
 
 		 183 aa  177  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  50.29 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  46.15 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  49.42 
 
 		 169 aa  175  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  49.71 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  48.3 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  45.86 
 
 		 187 aa  174  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  45.86 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  47.13 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  46.55 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  45.98 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  46.29 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  43.75 
 
 		 182 aa  164  8e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  43.18 
 
 		 182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  46.29 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  43.75 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1520  hexapaptide repeat-containing transferase  48.78 
 
 		 175 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  46.78 
 
 		 189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  44.91 
 
 		 185 aa  154  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  43.75 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0858  hexapaptide repeat-containing transferase  40.8 
 
 		 172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  45.2 
 
 		 177 aa  151  5e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  45.61 
 
 		 170 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  43.93 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  40.96 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2116  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  44.07 
 
 		 224 aa  148  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  44.97 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1936  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  45.4 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>