51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3717 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  65.77 
 
 		 222 aa  310  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  64.41 
 
 		 232 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  60.45 
 
 		 220 aa  289  3e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  61.79 
 
 		 212 aa  279  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  61.79 
 
 		 212 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  0.00000000000496851 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  61.79 
 
 		 212 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  61.79 
 
 		 212 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000231362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  61.79 
 
 		 212 aa  275  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  60.85 
 
 		 212 aa  275  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  60.38 
 
 		 212 aa  272  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  59.43 
 
 		 212 aa  269  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  60.85 
 
 		 212 aa  262  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  56.62 
 
 		 220 aa  245  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  50.45 
 
 		 226 aa  227  9e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  47.49 
 
 		 223 aa  202  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  34.6 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  36.49 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  37.62 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  32.23 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  34.29 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  31.9 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  36.23 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  33.82 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  35.81 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  33.02 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  32.56 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  33.82 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  33.65 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  34.56 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  30.14 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  32.21 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  31.1 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  32.7 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  33.65 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  33.02 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  31.43 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 217 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.54 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  29.67 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  26.17 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  20.49 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.88 
 
 		 329 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>