180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3641 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  92.36 
 
 		 157 aa  300  9e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  92.36 
 
 		 157 aa  300  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  92.36 
 
 		 157 aa  300  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  91.08 
 
 		 157 aa  296  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  91.08 
 
 		 157 aa  296  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  91.08 
 
 		 157 aa  296  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  91.08 
 
 		 158 aa  296  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  91.08 
 
 		 157 aa  293  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  87.9 
 
 		 157 aa  284  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  85.99 
 
 		 157 aa  283  9e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06423  peroxiredoxin  84.08 
 
 		 157 aa  279  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000593  antioxidant putative  83.44 
 
 		 157 aa  278  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000019477  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  80.25 
 
 		 157 aa  265  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  78.34 
 
 		 157 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0966  putative antioxidant  78.98 
 
 		 157 aa  259  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.272131  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0147  redoxin domain-containing protein  77.85 
 
 		 158 aa  254  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  70.7 
 
 		 157 aa  227  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  59.87 
 
 		 157 aa  201  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  61.39 
 
 		 159 aa  197  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  57.83 
 
 		 167 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  57.83 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  56.63 
 
 		 169 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2222  redoxin domain-containing protein  54.43 
 
 		 160 aa  174  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.641019  decreased coverage  0.00328049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.32 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  55.97 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.69 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  55.97 
 
 		 162 aa  167  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3947  redoxin domain-containing protein  53.5 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  56.02 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0501  Redoxin domain protein  53.46 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  51.9 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.14 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  51.81 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  52.41 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4490  redoxin domain-containing protein  53.16 
 
 		 160 aa  160  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.570905  normal  0.306313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  54.88 
 
 		 168 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  53.61 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.6 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  53.66 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.61 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  53.61 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  53.61 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  52.41 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  53.01 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.45 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6935  Redoxin domain protein  51.27 
 
 		 160 aa  158  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  53.01 
 
 		 166 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  52.76 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3218  redoxin domain-containing protein  52.41 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0848811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  53.05 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2596  redoxin domain-containing protein  54.72 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  51.2 
 
 		 168 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3915  redoxin domain-containing protein  49.06 
 
 		 159 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145792 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  45.83 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  45.83 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  45.83 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6266  redoxin domain-containing protein  50.63 
 
 		 160 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.939113  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  48.28 
 
 		 185 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  51.2 
 
 		 190 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  51.2 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  51.2 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3020  Redoxin domain protein  51.9 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563791 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.2 
 
 		 168 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.2 
 
 		 168 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  50 
 
 		 192 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0042  anti-oxidant AhpCTSA family protein  51.81 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  50.31 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  52.44 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  49.39 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.05 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  52.38 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1067  peroxiredoxin  52.83 
 
 		 161 aa  151  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  53.37 
 
 		 168 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.4 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2472  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  49.69 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.935379  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0592  redoxin domain-containing protein  53.64 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2818  Redoxin domain protein  49.37 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1343  peroxiredoxin-like protein  49.69 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255262  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2595  redoxin domain-containing protein  49.37 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2623  Redoxin domain protein  49.37 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0899  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  49.69 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0478  ahpC/TSA family protein  49.69 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.210689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3057  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50.31 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1257  Redoxin domain protein  49.06 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0661  Redoxin domain protein  52.2 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.165122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0619  Redoxin domain protein  50.94 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2558  redoxin domain-containing protein  49.07 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3052  redoxin domain-containing protein  49.09 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2700  redoxin domain protein  49.09 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4747  Redoxin domain protein  49.06 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  46.1 
 
 		 242 aa  144  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3087  redoxin domain-containing protein  50.3 
 
 		 166 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4027  peroxiredoxin-like protein  48.43 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  45.57 
 
 		 249 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  48.23 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  45.16 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0483  thiol peroxidase  49.36 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  44.3 
 
 		 251 aa  141  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3007  redoxin domain-containing protein  47.2 
 
 		 162 aa  141  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>