More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3505 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 363 aa  741    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.82 
 
 		 367 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.86 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  57.14 
 
 		 359 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  56.03 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.29 
 
 		 359 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  55.46 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  55.74 
 
 		 359 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  55.74 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56 
 
 		 359 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  51.62 
 
 		 354 aa  343  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  46.13 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  36.47 
 
 		 380 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  31.34 
 
 		 422 aa  157  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  34.25 
 
 		 386 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 390 aa  139  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  31.35 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 420 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  34.87 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 368 aa  126  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  36.08 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0310  hypothetical protein  27.92 
 
 		 361 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.720618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  26.79 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  37.25 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  33.62 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  32.99 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  37.1 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  34.12 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  26.18 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  26.18 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  26.27 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  27.22 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  26.92 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 376 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  34.72 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  26.51 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  27.5 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  34.38 
 
 		 381 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  28.67 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  25.86 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  29.22 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  26.92 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.79 
 
 		 426 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000104287  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1409  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  25.96 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00593294  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  30.81 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  23.4 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 425 aa  99.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  29.1 
 
 		 786 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 445 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  31.58 
 
 		 442 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.64 
 
 		 401 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.09 
 
 		 370 aa  93.2  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  26.13 
 
 		 376 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 382 aa  92.8  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 612 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  33.33 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 		 408 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  33.17 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  27.45 
 
 		 438 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  26.97 
 
 		 597 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 394 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 468 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.08 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  30.77 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0173853  decreased coverage  0.000998378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0957  histidine kinase  28.18 
 
 		 378 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  24.57 
 
 		 406 aa  86.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.35 
 
 		 726 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  29.3 
 
 		 392 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  26.18 
 
 		 413 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 372 aa  86.3  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  24.85 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  31.63 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.92 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.99 
 
 		 581 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  29.55 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  24.85 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  27.01 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.55 
 
 		 744 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  28.5 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.25 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>