242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3489 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3845  hypothetical protein  88.85 
 
 		 287 aa  523  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  87.11 
 
 		 287 aa  517  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4569  hypothetical protein  89.2 
 
 		 287 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000202204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  81.18 
 
 		 287 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  81.18 
 
 		 287 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  81.88 
 
 		 287 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  81.88 
 
 		 287 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  81.18 
 
 		 287 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  80.84 
 
 		 287 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  81.88 
 
 		 287 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  81.18 
 
 		 287 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  81.88 
 
 		 287 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  79.79 
 
 		 287 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  79.79 
 
 		 287 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  77.35 
 
 		 309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  64.81 
 
 		 287 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  64.46 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  64.46 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  65.16 
 
 		 287 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  64.46 
 
 		 287 aa  384  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  63.07 
 
 		 287 aa  381  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  64.46 
 
 		 287 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  63.76 
 
 		 287 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  63.19 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  63.54 
 
 		 288 aa  378  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  63.41 
 
 		 287 aa  378  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2588  hypothetical protein  62.85 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0107  hypothetical protein  60.63 
 
 		 287 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  61.67 
 
 		 287 aa  371  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  61.32 
 
 		 287 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03501  hypothetical protein  63.76 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137526  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0061  YicC domain protein  63.76 
 
 		 287 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3979  hypothetical protein  63.76 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.200033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3853  hypothetical protein  63.76 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.349633  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4145  hypothetical protein  63.76 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0120633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5014  hypothetical protein  63.76 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4069  hypothetical protein  63.76 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0067  hypothetical protein  63.76 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0211389  hitchhiker  0.00000185241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03453  hypothetical protein  63.86 
 
 		 285 aa  363  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123292  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3952  hypothetical protein  62.72 
 
 		 287 aa  362  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3934  hypothetical protein  62.72 
 
 		 287 aa  362  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.818058  hitchhiker  0.00001038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4061  hypothetical protein  62.72 
 
 		 287 aa  362  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.879365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4015  hypothetical protein  62.72 
 
 		 287 aa  362  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4122  hypothetical protein  62.37 
 
 		 287 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4283  hypothetical protein  59.58 
 
 		 290 aa  357  9e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  59.58 
 
 		 287 aa  355  3.9999999999999996e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3652  hypothetical protein  57.84 
 
 		 287 aa  352  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0180  hypothetical protein  54.14 
 
 		 288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0076  hypothetical protein  51.2 
 
 		 287 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  51.74 
 
 		 287 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0212  hypothetical protein  50.52 
 
 		 287 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6111  hypothetical protein  51.04 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70430  hypothetical protein  51.04 
 
 		 287 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5548  hypothetical protein  49.83 
 
 		 287 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02840  hypothetical protein  51.2 
 
 		 287 aa  275  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5203  hypothetical protein  50 
 
 		 287 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0178  hypothetical protein  49.32 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.952539  hitchhiker  0.0000731437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4362  hypothetical protein  49.83 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637906  normal  0.0170975 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0406  hypothetical protein  46.34 
 
 		 287 aa  271  8.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.71757  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1781  hypothetical protein  45.99 
 
 		 287 aa  268  5e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.843974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5343  hypothetical protein  49.32 
 
 		 287 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3207  hypothetical protein  47.92 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  47.22 
 
 		 288 aa  265  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  47.77 
 
 		 288 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  47.75 
 
 		 289 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  48.29 
 
 		 287 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  48.29 
 
 		 287 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  47.08 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  45.14 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  46.88 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  47.04 
 
 		 286 aa  249  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  43.21 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  43.21 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  43.4 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  40.28 
 
 		 287 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  42.36 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02368  hypothetical protein  45.23 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4572  hypothetical protein  90.23 
 
 		 129 aa  235  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000166313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  44.64 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  41.67 
 
 		 288 aa  222  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3848  hypothetical protein  42.27 
 
 		 288 aa  221  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  41.32 
 
 		 288 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  41.64 
 
 		 293 aa  218  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  39.93 
 
 		 288 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0065  hypothetical protein  40.07 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2156  hypothetical protein  39.55 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00239599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2277  hypothetical protein  39.87 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268275  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2474  hypothetical protein  39.55 
 
 		 311 aa  208  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0855  hypothetical protein  39.87 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1957  hypothetical protein  38.91 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.330049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4106  hypothetical protein  37.13 
 
 		 307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0456946  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1585  hypothetical protein  37.79 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3050  hypothetical protein  37.79 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0814  hypothetical protein  37.79 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.506209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2647  hypothetical protein  37.79 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2950  hypothetical protein  37.79 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.2121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3016  hypothetical protein  37.79 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.2767  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1965  hypothetical protein  37.79 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>