More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3459 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  78.03 
 
 
578 aa  957  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  77.82 
 
 
583 aa  948  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3810  peptidoglycan glycosyltransferase  76.36 
 
 
582 aa  906  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  86.51 
 
 
578 aa  1044  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  54.55 
 
 
585 aa  641  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  87.54 
 
 
578 aa  1061  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.06404e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  77.99 
 
 
583 aa  950  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  77.64 
 
 
584 aa  942  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46698e-10 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  77.64 
 
 
584 aa  942  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  77.99 
 
 
583 aa  942  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  77.12 
 
 
583 aa  943  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  77.64 
 
 
584 aa  942  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
578 aa  1187  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  87.37 
 
 
578 aa  1057  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  74.7 
 
 
581 aa  923  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  77.64 
 
 
584 aa  942  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  77.99 
 
 
583 aa  950  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  55 
 
 
586 aa  657  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2650  peptidoglycan synthetase FtsI precursor (peptidoglycan glycosyltransferase 3) (penicillin-binding protein 3)  53.97 
 
 
579 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  52.85 
 
 
601 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004496  cell division protein FtsI (Peptidoglycan synthetase)  52.46 
 
 
597 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1985  penicillin-binding protein 3  51.36 
 
 
580 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  51.14 
 
 
610 aa  577  1e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4471  peptidoglycan synthetase FtsI  51.22 
 
 
591 aa  572  1e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  48.39 
 
 
587 aa  559  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  48.68 
 
 
588 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  48.5 
 
 
588 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  48.5 
 
 
588 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  48.5 
 
 
588 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  48.5 
 
 
588 aa  558  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  48.5 
 
 
588 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  48.5 
 
 
588 aa  558  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  48.5 
 
 
588 aa  558  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.5 
 
 
588 aa  558  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  48.21 
 
 
588 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.75 
 
 
587 aa  551  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  48.21 
 
 
588 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  4.90417e-08 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  48.21 
 
 
588 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  48.21 
 
 
588 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  48.21 
 
 
588 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  46.29 
 
 
587 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.04 
 
 
587 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.86 
 
 
587 aa  550  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  46.29 
 
 
587 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  46.11 
 
 
587 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  48.26 
 
 
588 aa  538  1e-152  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0642  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.04 
 
 
587 aa  538  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407482  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  45.91 
 
 
599 aa  509  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0763  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.07 
 
 
570 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2199  peptidoglycan synthetase FtsI  46.19 
 
 
578 aa  493  1e-138  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  45.24 
 
 
581 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  45.24 
 
 
581 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.03537e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  45.24 
 
 
581 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  45.24 
 
 
581 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1479  peptidoglycan synthetase FtsI  45.05 
 
 
581 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0193532  normal  0.796051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57425  penicillin-binding protein 3  43.76 
 
 
579 aa  469  1e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4990  penicillin-binding protein 3  43.94 
 
 
579 aa  471  1e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2392  peptidoglycan synthetase FtsI  45.52 
 
 
572 aa  467  1e-130  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00596115  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0842  peptidoglycan synthetase FtsI  42.48 
 
 
568 aa  468  1e-130  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2275  peptidoglycan synthetase FtsI  44.74 
 
 
583 aa  459  1e-128  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.482519 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2196  peptidoglycan synthetase FtsI  43.96 
 
 
570 aa  461  1e-128  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2867  peptidoglycan glycosyltransferase  44.97 
 
 
570 aa  458  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2053  peptidoglycan glycosyltransferase  44.5 
 
 
613 aa  457  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.830537  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1974  peptidoglycan glycosyltransferase  44.5 
 
 
613 aa  456  1e-127  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04372  peptidoglycan synthetase FtsI  44.73 
 
 
622 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4518  peptidoglycan glycosyltransferase  42.06 
 
 
583 aa  447  1e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.933479  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2207  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.01 
 
 
571 aa  446  1e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.345655  normal  0.115802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2097  peptidoglycan glycosyltransferase  43.89 
 
 
575 aa  443  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0375891  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4393  peptidoglycan glycosyltransferase  41.85 
 
 
582 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111349  normal  0.213758 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  43.51 
 
 
548 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0938  peptidoglycan glycosyltransferase  42.06 
 
 
578 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1331  peptidoglycan glycosyltransferase  41.85 
 
 
582 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  42.24 
 
 
579 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2620  peptidoglycan glycosyltransferase  43.12 
 
 
587 aa  445  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  1.28115e-11 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2434  penicillin-binding protein 3  42.81 
 
 
575 aa  439  1e-122  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  43.51 
 
 
552 aa  441  1e-122  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2458  peptidoglycan glycosyltransferase  41.94 
 
 
580 aa  442  1e-122  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0916  peptidoglycan synthetase FtsI  42.42 
 
 
575 aa  439  1e-122  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0947  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  42.29 
 
 
553 aa  435  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  39.85 
 
 
582 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0977  peptidoglycan synthetase FtsI precursor  42.11 
 
 
553 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4108  peptidoglycan glycosyltransferase  41.43 
 
 
576 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221259  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  39.23 
 
 
577 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4679  peptidoglycan synthetase FtsI  39.89 
 
 
580 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.659612  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2500  peptidoglycan glycosyltransferase  42.91 
 
 
587 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4414  penicillin-binding protein  41.26 
 
 
575 aa  429  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00243453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.64 
 
 
614 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3824  peptidoglycan glycosyltransferase  39.96 
 
 
578 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0444  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.91 
 
 
619 aa  422  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0516  peptidoglycan glycosyltransferase  41.5 
 
 
614 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.316691 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  42.06 
 
 
595 aa  417  1e-115  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  39.9 
 
 
577 aa  418  1e-115  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4123  peptidoglycan glycosyltransferase  39.14 
 
 
630 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3649  peptidoglycan glycosyltransferase  39.32 
 
 
630 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00810793  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0044  penicillin-binding protein  39.39 
 
 
594 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1056  penicillin-binding protein  39.39 
 
 
594 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300075  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4378  peptidoglycan glycosyltransferase  38.96 
 
 
618 aa  412  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.7 
 
 
595 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.7 
 
 
595 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3134  peptidoglycan synthetase FtsI  42.25 
 
 
605 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>