More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3324 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3324  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  736    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0704  hypothetical protein  71.02 
 
 		 363 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  74.33 
 
 		 335 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3286  hypothetical protein  75.22 
 
 		 335 aa  531  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3633  hypothetical protein  72.86 
 
 		 350 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2449  hypothetical protein  72.24 
 
 		 335 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.861715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2332  hypothetical protein  72.24 
 
 		 335 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.97863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2332  hypothetical protein  71.94 
 
 		 335 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.946528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2014  hypothetical protein  71.94 
 
 		 335 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2451  hypothetical protein  71.64 
 
 		 380 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1873  hypothetical protein  71.86 
 
 		 335 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2105  hypothetical protein  71.56 
 
 		 335 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1912  hypothetical protein  73.04 
 
 		 321 aa  501  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3595  hypothetical protein  68.56 
 
 		 335 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.222828  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  53.8 
 
 		 338 aa  345  5e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  53.78 
 
 		 338 aa  342  7e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4815  hypothetical protein  51.48 
 
 		 338 aa  332  9e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195224  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4481  hypothetical protein  50.76 
 
 		 338 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  49.24 
 
 		 338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1491  hypothetical protein  31.79 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  31.08 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  31.13 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  32.71 
 
 		 699 aa  116  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  31.23 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  31.15 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  32.08 
 
 		 320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  30.12 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2359  hypothetical protein  29.28 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  30.56 
 
 		 310 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1486  hypothetical protein  33.21 
 
 		 303 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000118993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  34.5 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  29.13 
 
 		 398 aa  113  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2556  hypothetical protein  30.25 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  30.18 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  31.75 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  30.56 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  31.75 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  30.72 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  31.75 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  30.06 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1551  hypothetical protein  32.48 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1545  hypothetical protein  32.85 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013291  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.76 
 
 		 308 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  26.98 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  30.57 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2919  hypothetical protein  32.13 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  32.71 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2701  hypothetical protein  31.39 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000560458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  28.98 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  30.95 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2571  oxidoreductase  28.48 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  28.86 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.04 
 
 		 701 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  30.22 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  30.69 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  30.72 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  29.81 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04640  hypothetical protein  29.92 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  32.5 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  28.01 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  28.35 
 
 		 398 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  30.58 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  30.77 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  28.63 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  28.63 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  31.76 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  27.09 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  27.59 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  28.63 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  30.03 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2397  hypothetical protein  29.94 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00356323  normal  0.487755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  31.76 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  29.79 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2385  hypothetical protein  30.83 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000477017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  30.89 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  29.35 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  28.52 
 
 		 409 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  27.46 
 
 		 399 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  27.56 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  31.49 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  29.3 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5354  SAM-dependent methyltransferase  30.49 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0694951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0619  hypothetical protein  26.17 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  29.35 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  28.17 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  27.05 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1818  PUA domain containing protein  26.6 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.165222  normal  0.7114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  29.32 
 
 		 412 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  29.05 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1214  hypothetical protein  26.88 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  31.33 
 
 		 397 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11313  hypothetical protein  26.69 
 
 		 411 aa  99.8  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493787  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1666  hypothetical protein  31.82 
 
 		 303 aa  99.8  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000201275  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1771  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.95 
 
 		 807 aa  99.4  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  25.96 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  25.66 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6906  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4073  SAM-dependent methyltransferase  29.37 
 
 		 402 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.910073  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  30.63 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  26.9 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>