More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3296 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  81.78 
 
 
450 aa  754    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  85.56 
 
 
450 aa  748    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  81.56 
 
 
450 aa  752    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  81.78 
 
 
450 aa  748    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  86.44 
 
 
450 aa  786    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  81.78 
 
 
450 aa  754    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  81.78 
 
 
450 aa  754    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  100 
 
 
450 aa  886    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  77.31 
 
 
453 aa  677    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  80.93 
 
 
451 aa  739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  82.89 
 
 
450 aa  758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  83.59 
 
 
451 aa  749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  82.89 
 
 
450 aa  758    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  82.67 
 
 
450 aa  756    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  79.33 
 
 
449 aa  697    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  78.22 
 
 
449 aa  699    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  62.36 
 
 
455 aa  545  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  60.26 
 
 
459 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  59.87 
 
 
455 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  60.75 
 
 
456 aa  544  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  59.87 
 
 
455 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  60.38 
 
 
456 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  58.33 
 
 
463 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  58.33 
 
 
457 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  58.33 
 
 
457 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  59.87 
 
 
456 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  59.87 
 
 
456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  59.33 
 
 
456 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  60 
 
 
446 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  59.68 
 
 
456 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  58.33 
 
 
456 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  54.13 
 
 
455 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  54.37 
 
 
455 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  54.37 
 
 
455 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  54.37 
 
 
455 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  54.37 
 
 
455 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  55.24 
 
 
455 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  55.24 
 
 
455 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  55.24 
 
 
455 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  55.24 
 
 
455 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  55.46 
 
 
455 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  55.24 
 
 
455 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  54.15 
 
 
451 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  55.24 
 
 
455 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  55.24 
 
 
455 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  55.02 
 
 
455 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  51.67 
 
 
476 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  53.35 
 
 
462 aa  461  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  53.15 
 
 
474 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  52.94 
 
 
460 aa  457  1e-127  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  53.15 
 
 
474 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  52.93 
 
 
474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  52.93 
 
 
474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  52.7 
 
 
474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  52.93 
 
 
474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  52.93 
 
 
474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  53.36 
 
 
496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  52.48 
 
 
474 aa  448  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  53.38 
 
 
475 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  52.7 
 
 
474 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  53.38 
 
 
478 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  53.38 
 
 
475 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  53.38 
 
 
478 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  53.38 
 
 
475 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  51.56 
 
 
487 aa  437  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  51.45 
 
 
481 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  51.45 
 
 
481 aa  431  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  51.45 
 
 
481 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3096  serine endoprotease  51.01 
 
 
485 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  52.38 
 
 
476 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  49.89 
 
 
465 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1042  serine endoprotease  51.01 
 
 
482 aa  411  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.88791  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  49.89 
 
 
460 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  49.89 
 
 
450 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  51.28 
 
 
457 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  47.12 
 
 
469 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  46.65 
 
 
473 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  47.41 
 
 
458 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  47.58 
 
 
476 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  44.73 
 
 
458 aa  360  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  44.8 
 
 
478 aa  352  7e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  44.89 
 
 
477 aa  338  9e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  43.36 
 
 
481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  43.12 
 
 
481 aa  324  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  42.37 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  42.83 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  42.83 
 
 
451 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  42.37 
 
 
466 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  44.53 
 
 
478 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  41.31 
 
 
479 aa  310  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  43.33 
 
 
485 aa  299  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  49.26 
 
 
374 aa  295  9e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  40.71 
 
 
513 aa  295  9e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  39.66 
 
 
467 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.83 
 
 
476 aa  289  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  43.39 
 
 
471 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  39.96 
 
 
472 aa  289  8e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  40.31 
 
 
472 aa  288  9e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  41.9 
 
 
502 aa  288  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.51 
 
 
476 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>