77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3148 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1105  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  40.97 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  35.17 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2119  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.024767  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  37.16 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1721  transcriptional regulator, MarR family  44.27 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00761179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 202 aa  102  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1446  regulatory protein MarR  44.27 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2962  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3090  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.742362  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0247  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0218  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.812852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2725  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 155 aa  96.7  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  38.3 
 
 		 182 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  45.36 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3934  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.530394  decreased coverage  0.00586866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12043  hypothetical protein  34.85 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.506773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1036  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0755699  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0283  hypothetical protein  27.91 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000125013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0862  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.529832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1560  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  35.58 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  26.5 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0187  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.713112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  26.96 
 
 		 283 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  31.51 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  28.44 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  24.35 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  24.35 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  21.43 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  27.12 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  26.67 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 167 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  22.94 
 
 		 150 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0862  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3588  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 151 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  22.07 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0365  transcriptional regulator, MarR family  20 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4054  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 323 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0352596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 151 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 157 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>