92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3091 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  50.29 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  48.47 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  47.09 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  44.97 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  38.12 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  40.26 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  36.63 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  28.48 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  30.09 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  31.85 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  25.58 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  31.82 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  27 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  28.03 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  31.68 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  29.46 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  31.37 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  33.04 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  30.95 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  31.9 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  31.9 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  32.26 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  30.95 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  31.75 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  31.9 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  31.9 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  31.9 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  29.07 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  29.35 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  30.3 
 
 		 161 aa  53.9  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  30 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  31.58 
 
 		 153 aa  52.8  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  28.26 
 
 		 165 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  26.17 
 
 		 165 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  30.16 
 
 		 158 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 		 547 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  31.52 
 
 		 183 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  29.1 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  29.23 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  31.01 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  29.35 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  32.04 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  29.36 
 
 		 161 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 165 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  31.71 
 
 		 155 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  26.88 
 
 		 171 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  26.09 
 
 		 174 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  31.25 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  26.63 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  28.21 
 
 		 493 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  28.68 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  24.85 
 
 		 549 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  27.17 
 
 		 159 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  29.31 
 
 		 555 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 		 575 aa  45.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  28.68 
 
 		 158 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  27.01 
 
 		 158 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  27.2 
 
 		 165 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  28.68 
 
 		 158 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  25.49 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  30.33 
 
 		 522 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  26.61 
 
 		 178 aa  45.1  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  26.79 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 658 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  27.93 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  29.17 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  29.21 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  32.29 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  30.48 
 
 		 700 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  31.76 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  28.83 
 
 		 673 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  30.38 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  30.38 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  26.95 
 
 		 541 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  24.48 
 
 		 513 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  30.56 
 
 		 476 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  29.29 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  26.97 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  25.96 
 
 		 512 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  25.9 
 
 		 646 aa  42  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  26.17 
 
 		 492 aa  42  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  24.64 
 
 		 530 aa  41.6  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  24.41 
 
 		 494 aa  41.6  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  29.67 
 
 		 174 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  30.21 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>