241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2989 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  100 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  53.37 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  57.63 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  55.19 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  52.31 
 
 		 207 aa  174  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  45 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  44.13 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  41.09 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  43.72 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  41.9 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  39.34 
 
 		 202 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  41.72 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  38.07 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  37.97 
 
 		 218 aa  124  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  35.87 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  33.94 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  40.24 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  32.35 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  36.96 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  35.59 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  36 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  30.69 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  36.84 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  33.89 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  36.16 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.97 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  32.52 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  33.53 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  31.12 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2747  lysophospholipase L1-like protein  32.95 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  34.12 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  31.12 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  31.71 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1696  arylesterase  30.73 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.122865  normal  0.277119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  30.61 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  31.55 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  30.48 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  33.33 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  32.93 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.7 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  33.7 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  46.3 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  30.61 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  31.67 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  29.94 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  31.22 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  32.61 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  36.99 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2898  arylesterase  29.55 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0179811  hitchhiker  0.000609296 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  29.55 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1599  lipolytic protein G-D-S-L family  32.6 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  32.84 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  32.22 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  27.36 
 
 		 250 aa  68.2  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  36.3 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  30.86 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.84 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  29.59 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  29.55 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  31.32 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  29.8 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  29.95 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1901  GDSL family lipase  31.94 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0627412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  28.89 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  31.89 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  32.46 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  32.77 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  30.48 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  28.98 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  28.98 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  30.29 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  36.42 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  36.42 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  31.89 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  30.32 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  32.5 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0686  acyl-CoA thioesterase I precursor  28 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2141  GDSL family lipase  32.02 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2714  lipolytic protein  29.47 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0772  GDSL family lipase  25.51 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  32.1 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.02 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  30.94 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  30.17 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  29.71 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  31.07 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  30.88 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  29.68 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  34 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  29.61 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  31.07 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  31.32 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  32 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  28.57 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  33.58 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  35.04 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1162  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.03 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.232056  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  32.47 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  32 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  31 
 
 		 286 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>