More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2938 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  73.46 
 
 		 264 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  69.43 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3152  rare lipoprotein A  75.31 
 
 		 260 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0852  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  55.73 
 
 		 278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  56.44 
 
 		 270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2872  rare lipoprotein A  50.18 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3456  rare lipoprotein A  49.1 
 
 		 277 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000968437  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3278  rare lipoprotein A  49.1 
 
 		 277 aa  298  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000396769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3320  rare lipoprotein A  48.75 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103615  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1089  rare lipoprotein A  48.75 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000493551  hitchhiker  0.00000747193 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0988  rare lipoprotein A  55.83 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000365675  normal  0.010381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1053  rare lipoprotein A  55.83 
 
 		 280 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  hitchhiker  0.00641376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0992  rare lipoprotein A  55.83 
 
 		 280 aa  292  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257721  normal  0.149582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1165  rare lipoprotein A  55 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  50 
 
 		 263 aa  255  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004224  rare lipoprotein A precursor  51.2 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  49.8 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  47.39 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01215  hypothetical protein  51.39 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  44.44 
 
 		 322 aa  241  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0983  rare lipoprotein A  46.06 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  42.72 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  42.38 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1548  rare lipoprotein A  43.01 
 
 		 290 aa  214  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1971  rare lipoprotein A  49.28 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  45.68 
 
 		 285 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  39.42 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  56.44 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  56.25 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1518  hypothetical protein  44.12 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0952  rare lipoprotein A family protein  40 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1060  rare lipoprotein A  40 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  44.95 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1465  hypothetical protein  44.54 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  58.17 
 
 		 417 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  58.17 
 
 		 415 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  40.54 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2496  rare lipoprotein A  38.39 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  55.13 
 
 		 341 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  59.59 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  42.51 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  54.49 
 
 		 342 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  42.46 
 
 		 332 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  44.1 
 
 		 333 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  59.72 
 
 		 335 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  58.45 
 
 		 342 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  43.91 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  57.75 
 
 		 342 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1268  rare lipoprotein A  37.68 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  57.75 
 
 		 337 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  54.93 
 
 		 423 aa  165  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5161  rare lipoprotein A  51.83 
 
 		 391 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1011  rare lipoprotein A  51.37 
 
 		 352 aa  159  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04283  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 471 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  45 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0662  rare lipoprotein A  37.96 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  39.09 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  51.03 
 
 		 381 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  43.14 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  47.83 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  37.14 
 
 		 282 aa  155  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  50.69 
 
 		 394 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  47.43 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  39.45 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  45.9 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  48.77 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1244  rare lipoprotein A  47.83 
 
 		 409 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.069168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  46.71 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  49.07 
 
 		 314 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  51.02 
 
 		 283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  46.86 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  44.58 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 474 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  36 
 
 		 254 aa  145  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  46.88 
 
 		 314 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0519  rare lipoprotein A  37.22 
 
 		 246 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.986094  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  43.78 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  49.35 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  43.78 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  43.78 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  58.41 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  46.95 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  52.5 
 
 		 468 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  42.07 
 
 		 375 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  45.96 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  52.8 
 
 		 382 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  45.11 
 
 		 424 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  50.81 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  50.81 
 
 		 398 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  51.64 
 
 		 442 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  42.16 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  42.22 
 
 		 200 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  53.23 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  52.05 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  40.24 
 
 		 370 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  55.65 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  41.67 
 
 		 200 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>