100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2914 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2914  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 		 216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000324286  normal  0.441694 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  54.41 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3461  outer membrane lipoprotein LolB  55.25 
 
 		 218 aa  221  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0667609  normal  0.949201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3687  outer membrane lipoprotein LolB  55.94 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0163127  normal  0.471305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3171  outer membrane lipoprotein LolB  57.64 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00520564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0767  outer membrane lipoprotein LolB  57.64 
 
 		 214 aa  208  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000782252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0795  outer membrane lipoprotein LolB  57.14 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000501463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0694  outer membrane lipoprotein LolB  56.65 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3616  outer membrane lipoprotein LolB  56.65 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3835  outer membrane lipoprotein LolB  56.65 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3739  outer membrane lipoprotein LolB  56.16 
 
 		 214 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.137488  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3548  outer membrane lipoprotein LolB  56.16 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434882  hitchhiker  0.0000361379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0918  outer membrane lipoprotein LolB  47.74 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.126701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0799  outer membrane lipoprotein LolB  54.19 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000308164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0721  outer membrane lipoprotein LolB  50 
 
 		 203 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0885014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  44.02 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2565  outer membrane lipoprotein LolB  29.56 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0913  outer membrane lipoprotein LolB  30.21 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  29.94 
 
 		 200 aa  84.7  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01248  outer membrane lipoprotein LolB  31.16 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1166  outer membrane lipoprotein LolB  26.98 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.965253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  26.4 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  26.96 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  28.43 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  28.43 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  28.93 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  28.43 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1988  outer membrane lipoprotein LolB  28.65 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.253229  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1758  outer membrane lipoprotein LolB  30.49 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004205  outer membrane lipoprotein LolB precursor  29.65 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000360033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  27.96 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  27.62 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  27.5 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0385  outer membrane lipoprotein LolB  30.21 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0388895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  27.96 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  27.23 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  30.37 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2116  outer membrane lipoprotein LolB  28.87 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3555  putative outer membrane lipoprotein LolB  23.64 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.460457  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  25.91 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2363  outer membrane lipoprotein LolB  26.63 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0343  outer membrane lipoprotein LolB  26.11 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.447592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  25.75 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  28.87 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  26.67 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2409  outer membrane lipoprotein LolB  28.14 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  25.14 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  26.99 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  28.65 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1974  outer membrane lipoprotein LolB  27.55 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356364  normal  0.962813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1360  outer membrane lipoprotein LolB  27.55 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000530906  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1910  outer membrane lipoprotein LolB  27.55 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.728098 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1544  outer membrane lipoprotein LolB  27.55 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0381388  normal  0.080998 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1916  outer membrane lipoprotein LolB  28.48 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  28.05 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000607555  normal  0.239463 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0724  outer membrane lipoprotein LolB  28.48 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.639372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1373  outer membrane lipoprotein LolB  28.05 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.52349e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01184  outer membrane lipoprotein LolB precursor  28.05 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21984  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1854  outer membrane lipoprotein LolB  26.56 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2417  outer membrane lipoprotein LolB  28.05 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01194  hypothetical protein  28.05 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1357  outer membrane lipoprotein LolB  28.05 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000990201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1314  outer membrane lipoprotein LolB  28.05 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  28.48 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000433771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1690  outer membrane lipoprotein LolB  28.05 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000307213  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  24.23 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  24.23 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2438  outer membrane lipoprotein LolB  28.05 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  28.48 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  27.32 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2209  outer membrane lipoprotein LolB  26.03 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2120  outer membrane lipoprotein LolB  27.23 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2181  outer membrane lipoprotein LolB  28.48 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.865932  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  28.14 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  27.56 
 
 		 203 aa  62  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04545  outer membrane lipoprotein LolB  25.62 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.866316  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  24.1 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2383  outer membrane lipoprotein LolB  27.45 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2763  outer membrane lipoprotein LolB, putative  27.45 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2070  outer membrane lipoprotein LolB  29.94 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00533994  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0291  outer membrane lipoprotein LolB  22.15 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  22.28 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  22.28 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0174  hypothetical protein  27.62 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0291  outer membrane lipoprotein LolB  24.74 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2103  outer membrane lipoprotein LolB  26.47 
 
 		 240 aa  52  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0502243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1658  putative outer membrane lipoprotein  28 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0187  outer membrane lipoprotein LolB  24.31 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.305755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4343  putative lipoprotein  27.97 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3117  outer membrane lipoprotein LolB  30.34 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.632142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0756  outer membrane lipoprotein LolB  30.34 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0901  putative lipoprotein  27.87 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0085  outer membrane lipoprotein LolB  30.34 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1505  outer membrane lipoprotein LolB  30.34 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0117996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2933  outer membrane lipoprotein LolB  30.34 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127236  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0588  outer membrane lipoprotein LolB  30.34 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0129159  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0572  outer membrane lipoprotein LolB  30.34 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00109042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  27.21 
 
 		 210 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0477  outer membrane lipoprotein LolB  30.84 
 
 		 209 aa  42  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>