More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2677 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2677  putative electron transfer flavoprotein FixA  100 
 
 
257 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4039  putative electron transfer flavoprotein FixA  75.49 
 
 
257 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3230  putative electron transfer flavoprotein FixA  75.49 
 
 
257 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.789005  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.18 
 
 
256 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0084  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.18 
 
 
256 aa  295  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0085  putative electron transfer flavoprotein FixA  60.39 
 
 
256 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0082  putative electron transfer flavoprotein FixA  60 
 
 
256 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0081  putative electron transfer flavoprotein FixA  60.39 
 
 
256 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00045  predicted electron transfer flavoprotein subunit, ETFP adenine nucleotide-binding domain protein  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3558  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0043  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570899  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3614  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0641152 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
277 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0045  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00044  hypothetical protein  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0047  putative electron transfer flavoprotein FixA  61.09 
 
 
256 aa  286  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4606  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  54.47 
 
 
256 aa  262  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1019  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  52.53 
 
 
256 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1450  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  50.19 
 
 
254 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.970254  normal  0.335905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1818  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  50.19 
 
 
254 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1990  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  50.58 
 
 
254 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100268  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1484  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  50.58 
 
 
254 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0299245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1466  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  49.81 
 
 
254 aa  241  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.2749 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1945  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  49.03 
 
 
254 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.186501  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1914  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  49.03 
 
 
254 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1498  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  48.64 
 
 
254 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1934  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  48.64 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2414  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  48.64 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1900  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  48.64 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01666  hypothetical protein  48.25 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01655  hypothetical protein  48.25 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0572  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  49.8 
 
 
256 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.118411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1395  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  51.36 
 
 
254 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0311  putative electron transfer flavoprotein YdiQ  45.53 
 
 
256 aa  216  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2873  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  46.3 
 
 
255 aa  210  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1824  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  43.97 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.096879  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  42.99 
 
 
257 aa  158  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.315122 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0267  electron transfer flavoprotein beta subunit-like protein  44.06 
 
 
258 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09230  electron transfer flavoprotein, beta subunit  44.26 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08790  electron transfer flavoprotein, beta subunit  45.37 
 
 
247 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.515982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1841  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.57 
 
 
256 aa  135  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349047  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02670  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.85 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.842204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3104  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  42.08 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268097 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2122  hypothetical protein  34.38 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1608  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.58 
 
 
263 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0303  electron transfer flavoprotein, beta subunit  28.84 
 
 
262 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1372  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.19 
 
 
263 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.505758  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0308  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  28.84 
 
 
262 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0331  electron transfer flavoprotein beta-subunit  33.61 
 
 
240 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0130  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  28.5 
 
 
263 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.999111  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1210  electron transfer flavoprotein beta-subunit  34.62 
 
 
259 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3648  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.02 
 
 
257 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1103  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.3 
 
 
259 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0274897  normal  0.0559611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4535  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.88 
 
 
260 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0741133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3679  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.95 
 
 
262 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0429  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.6 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2354  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.17 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28260  electron transfer flavoprotein, beta subunit  34.59 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6051  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  35.66 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0655  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  30.73 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.894194  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1102  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.44 
 
 
264 aa  95.5  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.275648  hitchhiker  0.00234643 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1835  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.99 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.163048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1315  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  26.69 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.820816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2862  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.4 
 
 
257 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3166  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.89 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0593  electron transfer flavoprotein, beta subunit  36.06 
 
 
259 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0756  electron transfer flavoprotein beta-subunit  28.63 
 
 
256 aa  92.4  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.480219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0914  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.34 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0862811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2846  electron transfer flavoprotein subunits alpha/beta  32.95 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0256  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.62 
 
 
259 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0672629  normal  0.0851543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2299  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.62 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1383  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.61 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1545  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  29.46 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.02 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2583  electron transfer flavoprotein, beta subunit/FixA family protein  31.16 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2285  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.16 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1713  electron transfer flavoprotein subunit beta  30.74 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1601  electron transfer flavoprotein beta-subunit  30.08 
 
 
258 aa  89  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1469  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.86 
 
 
258 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1935  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  29.26 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988046  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2784  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.86 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4258  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  29.7 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0058  electron transfer flavoprotein subunit beta  30.67 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4092  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.52 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4650  electron transfer flavoprotein, beta subunit  29.7 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4270  electron transfer flavoprotein, beta subunit (beta-ETF)  29.7 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4635  electron transfer flavoprotein, beta subunit  29.7 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2153  electron transfer flavoprotein subunit beta  30.61 
 
 
258 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000153596  normal  0.854717 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4651  electron transfer flavoprotein, beta subunit  29.7 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4351  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.7 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0577  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  29.63 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4419  electron transfer flavoprotein subunit beta  29.7 
 
 
257 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2258  electron transfer flavoprotein subunit beta  30.57 
 
 
271 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00448777  hitchhiker  0.0000000000493094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4760  electron transfer flavoprotein subunit beta  29.7 
 
 
257 aa  87  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0584  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.41 
 
 
260 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3575  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.72 
 
 
259 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0138442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0830  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.05 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3038  electron transfer flavoprotein beta-subunit  31.13 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2006  electron transfer flavoprotein beta-subunit  29.69 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.249867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1858  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  31.76 
 
 
263 aa  85.1  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  0.923752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>