More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2658 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  100 
 
 
227 aa  461  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  81.5 
 
 
227 aa  384  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3195  putative ABC transporter, ATP-binding protein  81.06 
 
 
227 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  79.02 
 
 
237 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  78.12 
 
 
238 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  53.33 
 
 
229 aa  248  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  54.46 
 
 
246 aa  248  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  52.97 
 
 
230 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2507  ABC transporter related  51.35 
 
 
231 aa  241  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.44 
 
 
234 aa  238  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5302  ABC transporter related  51.77 
 
 
234 aa  228  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.155471  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1662  ABC transporter related  51.33 
 
 
234 aa  225  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.822676  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  50.74 
 
 
237 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0433  ABC transporter related  54.02 
 
 
233 aa  217  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  49.32 
 
 
236 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 
237 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  49.32 
 
 
237 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  48.17 
 
 
242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  50.22 
 
 
228 aa  215  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.65 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2019  ABC transporter related protein  45.25 
 
 
228 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0275435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1802  ABC transporter related  45.85 
 
 
234 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  47.77 
 
 
237 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2653  ABC transporter, ATP-binding protein  48.28 
 
 
214 aa  208  4e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.670995  normal  0.0652814 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.98 
 
 
228 aa  207  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  49.75 
 
 
228 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  46.64 
 
 
235 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 
253 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6690  ABC transporter, ATPase subunit  47.56 
 
 
234 aa  205  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810231  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  44.2 
 
 
224 aa  205  4e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
224 aa  205  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
224 aa  205  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  46.22 
 
 
253 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
224 aa  204  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 
224 aa  205  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0630  ABC transporter related  48.87 
 
 
268 aa  205  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0423789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  44.2 
 
 
224 aa  203  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  44.2 
 
 
224 aa  203  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  45.09 
 
 
224 aa  203  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  45.54 
 
 
226 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  47.87 
 
 
236 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 
224 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  45.25 
 
 
230 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  47.56 
 
 
235 aa  203  2e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
226 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 
230 aa  203  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  47.51 
 
 
252 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  50 
 
 
234 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2147  ABC transporter related  45.21 
 
 
252 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.852094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
226 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  45.78 
 
 
253 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.59 
 
 
225 aa  202  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.59 
 
 
225 aa  202  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
226 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  47.32 
 
 
231 aa  202  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 
231 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  46.85 
 
 
248 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 
226 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 
226 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
224 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  45.66 
 
 
235 aa  201  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  46.54 
 
 
250 aa  201  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  46.85 
 
 
233 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  45.78 
 
 
256 aa  201  9e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  46.19 
 
 
229 aa  200  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  45.33 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3149  ABC transporter related  46.26 
 
 
563 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  45.16 
 
 
244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  44.59 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  49.02 
 
 
230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  47.12 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.64 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  45.5 
 
 
222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.5 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  44.59 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  44.2 
 
 
239 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  43.11 
 
 
225 aa  199  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  44.14 
 
 
235 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  44.64 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.55 
 
 
647 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2318  ABC transporter related  45.81 
 
 
565 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  43.69 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  49.78 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
224 aa  198  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  49.11 
 
 
655 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.73 
 
 
226 aa  198  7e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2540  ABC transporter related  45.37 
 
 
241 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.656818  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  43.3 
 
 
225 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  44.29 
 
 
249 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  50.24 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  48.53 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.84 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>