More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2617 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  74.35 
 
 		 648 aa  945    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  74.42 
 
 		 648 aa  961    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  100 
 
 		 649 aa  1287    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  78.41 
 
 		 653 aa  1006    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  71.17 
 
 		 649 aa  899    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  74.11 
 
 		 648 aa  946    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  75.96 
 
 		 648 aa  922    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  74.27 
 
 		 648 aa  959    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  74.81 
 
 		 648 aa  946    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  82.59 
 
 		 649 aa  1051    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  74.81 
 
 		 648 aa  946    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  70.62 
 
 		 650 aa  918    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  80.59 
 
 		 649 aa  1038    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  74.11 
 
 		 648 aa  956    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  75.27 
 
 		 648 aa  959    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  48.94 
 
 		 657 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  46.8 
 
 		 720 aa  592  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  45.92 
 
 		 655 aa  531  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  44.79 
 
 		 654 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  39.12 
 
 		 662 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  41.97 
 
 		 656 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  39.88 
 
 		 674 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  39.88 
 
 		 659 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  41.16 
 
 		 659 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  39.3 
 
 		 660 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  39.1 
 
 		 652 aa  416  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  38.74 
 
 		 666 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  40.7 
 
 		 659 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  39.44 
 
 		 660 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  39.47 
 
 		 661 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.58 
 
 		 654 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  39.47 
 
 		 661 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  40.89 
 
 		 658 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  39.24 
 
 		 661 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  39.66 
 
 		 668 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  40.49 
 
 		 659 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.4 
 
 		 680 aa  399  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  39.75 
 
 		 661 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  39.01 
 
 		 663 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  39.47 
 
 		 664 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  39.48 
 
 		 678 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  38.27 
 
 		 661 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  38.94 
 
 		 663 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.84 
 
 		 669 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.84 
 
 		 669 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  38.84 
 
 		 669 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.84 
 
 		 669 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.84 
 
 		 669 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.84 
 
 		 669 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  39.69 
 
 		 667 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  39.14 
 
 		 667 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  39.41 
 
 		 668 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  39.41 
 
 		 668 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  39.41 
 
 		 668 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  40.31 
 
 		 665 aa  385  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  39.38 
 
 		 666 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  39.19 
 
 		 670 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  39.4 
 
 		 661 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  39.19 
 
 		 670 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.33 
 
 		 579 aa  375  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  39.66 
 
 		 661 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  38.04 
 
 		 661 aa  364  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  39.22 
 
 		 655 aa  361  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  41.98 
 
 		 570 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  32.88 
 
 		 674 aa  354  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  34.27 
 
 		 636 aa  355  2e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.99 
 
 		 697 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.52 
 
 		 671 aa  347  6e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  33.48 
 
 		 666 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 		 672 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  39.89 
 
 		 574 aa  335  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  33.54 
 
 		 666 aa  331  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0907  sodium/hydrogen exchanger  34.8 
 
 		 563 aa  326  7e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 658 aa  326  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  32.88 
 
 		 666 aa  326  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  34.07 
 
 		 665 aa  325  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  35.34 
 
 		 630 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  35.51 
 
 		 630 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  34.3 
 
 		 664 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  35.1 
 
 		 629 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  34.88 
 
 		 568 aa  313  6.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  35.51 
 
 		 595 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  35.05 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5461  sodium/hydrogen exchanger  37.32 
 
 		 597 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  33.74 
 
 		 597 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5173  sodium/hydrogen exchanger  35.92 
 
 		 632 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  30.03 
 
 		 682 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  33.22 
 
 		 624 aa  306  9.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  33.51 
 
 		 624 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  30.24 
 
 		 665 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 		 583 aa  303  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3068  potassium efflux system protein  32.86 
 
 		 631 aa  301  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1668  potassium efflux system protein  34.28 
 
 		 610 aa  300  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.228254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1980  sodium/hydrogen exchanger  35.46 
 
 		 603 aa  300  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.846503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 688 aa  300  7e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.23 
 
 		 663 aa  299  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0266  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.07 
 
 		 602 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.07 
 
 		 602 aa  298  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3951  potassium efflux system protein  34.48 
 
 		 657 aa  298  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.959395 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3687  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.07 
 
 		 602 aa  297  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>