More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2583 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
307 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  80.78 
 
 
307 aa  495  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  77.85 
 
 
307 aa  481  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  78.36 
 
 
307 aa  474  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  73.62 
 
 
308 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  73.29 
 
 
308 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  73.29 
 
 
308 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  72.96 
 
 
307 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2510  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  73.68 
 
 
308 aa  448  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000427922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  72.96 
 
 
308 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  72.64 
 
 
308 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  72.64 
 
 
307 aa  442  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.27 
 
 
307 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1353  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.27 
 
 
308 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000384606  hitchhiker  0.00895875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1418  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.27 
 
 
308 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0628091  normal  0.474151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1406  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.27 
 
 
308 aa  434  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000428424  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.8 
 
 
308 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.21 
 
 
309 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  66.89 
 
 
311 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.82 
 
 
308 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.59 
 
 
309 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.61 
 
 
309 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.28 
 
 
309 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.7 
 
 
313 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.13 
 
 
308 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.78 
 
 
309 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.78 
 
 
309 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.75 
 
 
309 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.61 
 
 
310 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  62.78 
 
 
309 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.17 
 
 
313 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  64.92 
 
 
309 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.46 
 
 
309 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.18 
 
 
308 aa  363  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  60.83 
 
 
321 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.97 
 
 
310 aa  358  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.23 
 
 
311 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.34 
 
 
310 aa  358  6e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  63.23 
 
 
311 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.23 
 
 
311 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.23 
 
 
311 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.23 
 
 
311 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.23 
 
 
311 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.06 
 
 
312 aa  357  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  62.46 
 
 
309 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  62.75 
 
 
310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.9 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.26 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.9 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.17 
 
 
314 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.58 
 
 
311 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  64.59 
 
 
309 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.26 
 
 
311 aa  355  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.94 
 
 
311 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.75 
 
 
310 aa  354  7.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.58 
 
 
311 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.58 
 
 
311 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  61.78 
 
 
314 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.93 
 
 
309 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.26 
 
 
310 aa  354  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.61 
 
 
309 aa  352  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.43 
 
 
309 aa  352  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.94 
 
 
311 aa  351  8e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.29 
 
 
311 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.81 
 
 
309 aa  350  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  62.21 
 
 
311 aa  349  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.09 
 
 
310 aa  348  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60 
 
 
313 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.21 
 
 
319 aa  346  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.81 
 
 
308 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.7 
 
 
311 aa  346  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.56 
 
 
311 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  59.87 
 
 
314 aa  345  4e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  62.14 
 
 
309 aa  345  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.98 
 
 
310 aa  345  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  60.13 
 
 
314 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  61.69 
 
 
309 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.17 
 
 
309 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  59.87 
 
 
315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  57.74 
 
 
310 aa  342  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  61.17 
 
 
309 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.94 
 
 
310 aa  341  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.49 
 
 
349 aa  340  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.49 
 
 
309 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.49 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  54.37 
 
 
312 aa  338  7e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60.91 
 
 
308 aa  338  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.81 
 
 
309 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  54.05 
 
 
312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.32 
 
 
310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.11 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.77 
 
 
313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.68 
 
 
321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.26 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.46 
 
 
308 aa  335  5e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.11 
 
 
310 aa  335  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.98 
 
 
310 aa  335  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.74 
 
 
309 aa  335  7.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3730  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  60 
 
 
310 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0422  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  62.87 
 
 
310 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>