194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2471 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  81.08 
 
 		 609 aa  1009    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  73.77 
 
 		 607 aa  947    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  78.49 
 
 		 609 aa  1008    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  79.47 
 
 		 609 aa  1019    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  81.46 
 
 		 616 aa  1052    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  79.74 
 
 		 609 aa  1018    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  79.34 
 
 		 609 aa  998    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  79.87 
 
 		 611 aa  1021    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  78.49 
 
 		 610 aa  1011    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  75.49 
 
 		 609 aa  978    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  78.49 
 
 		 609 aa  1008    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  78.65 
 
 		 609 aa  1009    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1266    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  80.46 
 
 		 609 aa  1019    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  78.33 
 
 		 609 aa  1005    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  80.49 
 
 		 616 aa  1048    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  43.03 
 
 		 629 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  43.33 
 
 		 592 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  41.05 
 
 		 637 aa  488  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  41.07 
 
 		 635 aa  488  1e-136  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  41.38 
 
 		 611 aa  476  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  39.77 
 
 		 589 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  40.19 
 
 		 619 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  42.63 
 
 		 621 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0768  protein of unknown function DUF885  38.54 
 
 		 593 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  38.74 
 
 		 1283 aa  432  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  36.27 
 
 		 646 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  34.11 
 
 		 585 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  36.49 
 
 		 617 aa  386  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  34.32 
 
 		 603 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  33.88 
 
 		 603 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  36.52 
 
 		 587 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  33.71 
 
 		 603 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  36.25 
 
 		 616 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.81 
 
 		 601 aa  380  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  37.22 
 
 		 614 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.21 
 
 		 601 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  36.41 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  37.2 
 
 		 615 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  34.21 
 
 		 601 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  35.92 
 
 		 616 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  33.5 
 
 		 603 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  36.38 
 
 		 616 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  36.77 
 
 		 615 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  36.65 
 
 		 589 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.88 
 
 		 601 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  35.4 
 
 		 613 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  35.85 
 
 		 594 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.88 
 
 		 603 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  36.71 
 
 		 615 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  34.17 
 
 		 602 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  37.48 
 
 		 624 aa  372  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  37.1 
 
 		 605 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  36.7 
 
 		 615 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  33.97 
 
 		 602 aa  369  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  35.61 
 
 		 591 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  34.76 
 
 		 619 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  36.18 
 
 		 627 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  37.44 
 
 		 625 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  36.15 
 
 		 613 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  34.04 
 
 		 617 aa  365  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  34.73 
 
 		 599 aa  365  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  39.33 
 
 		 614 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  35.71 
 
 		 628 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  33.66 
 
 		 625 aa  360  4e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  38.49 
 
 		 611 aa  359  6e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  37.3 
 
 		 614 aa  359  8e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  38.49 
 
 		 607 aa  359  9e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  33.39 
 
 		 599 aa  359  9e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  38.49 
 
 		 607 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  38.49 
 
 		 607 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  37.39 
 
 		 614 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  34.86 
 
 		 618 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.7 
 
 		 583 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  37.43 
 
 		 614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  33.06 
 
 		 599 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  37.16 
 
 		 590 aa  353  7e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  36.66 
 
 		 617 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  35.11 
 
 		 605 aa  349  7e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  36.21 
 
 		 618 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  33.45 
 
 		 588 aa  348  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  35.69 
 
 		 629 aa  347  4e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3489  hypothetical protein  37.07 
 
 		 586 aa  347  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  34.87 
 
 		 595 aa  346  7e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  35.96 
 
 		 622 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  34.53 
 
 		 608 aa  343  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1202  hypothetical protein  35.87 
 
 		 584 aa  342  8e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  32.84 
 
 		 610 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  33.96 
 
 		 613 aa  331  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3854  hypothetical protein  36.47 
 
 		 593 aa  329  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  34.84 
 
 		 628 aa  327  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  34.26 
 
 		 633 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  35.38 
 
 		 621 aa  324  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0166  hypothetical protein  35.77 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  34.74 
 
 		 635 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  34.74 
 
 		 635 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  33.66 
 
 		 628 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  34.42 
 
 		 635 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  32.13 
 
 		 630 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27240  hypothetical protein  32.92 
 
 		 551 aa  302  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.354347  normal  0.473848 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>