More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2455 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  71.63 
 
 		 418 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  100 
 
 		 418 aa  860    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  79.51 
 
 		 424 aa  695    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  77.58 
 
 		 438 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  66.51 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  66.67 
 
 		 433 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  66.43 
 
 		 433 aa  591  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  66.67 
 
 		 433 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  66.67 
 
 		 433 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  67.06 
 
 		 431 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  67.06 
 
 		 431 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  66.35 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  65.87 
 
 		 434 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  66.27 
 
 		 419 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  61.06 
 
 		 423 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  60.88 
 
 		 428 aa  518  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  54.25 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  49.75 
 
 		 439 aa  391  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  49.13 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  46.97 
 
 		 439 aa  315  7e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  44.47 
 
 		 482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  45.29 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  36.95 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  40.63 
 
 		 458 aa  270  5e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  41.52 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  39.95 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  41.52 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  39.07 
 
 		 486 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  38.84 
 
 		 507 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  35.75 
 
 		 440 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  38.08 
 
 		 470 aa  242  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  34.35 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  34.43 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  34.05 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  34.05 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  34.05 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  34.05 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  34.05 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  34.05 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  34.05 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  34.05 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  38.86 
 
 		 419 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  34.81 
 
 		 439 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  34.59 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  34.59 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  34.59 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  34.12 
 
 		 439 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  34.2 
 
 		 439 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  41.46 
 
 		 550 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  32.37 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  37.24 
 
 		 462 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  34.04 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  31.75 
 
 		 429 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  35.28 
 
 		 491 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  32.46 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  35.75 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  32.41 
 
 		 436 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  35.38 
 
 		 466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  33.97 
 
 		 468 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  33.97 
 
 		 468 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  33.97 
 
 		 468 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  33.62 
 
 		 470 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  35.1 
 
 		 353 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  34.82 
 
 		 466 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  33.98 
 
 		 468 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  35.57 
 
 		 491 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  31.04 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  34.4 
 
 		 512 aa  204  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  32.45 
 
 		 475 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  34.31 
 
 		 475 aa  202  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  33.43 
 
 		 475 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  34.59 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  34.75 
 
 		 473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  33.93 
 
 		 472 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  35.48 
 
 		 475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  33.33 
 
 		 513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  35.48 
 
 		 473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  31.97 
 
 		 459 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.49 
 
 		 498 aa  196  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  31.75 
 
 		 477 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  34.8 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  31.16 
 
 		 477 aa  192  8e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  34.68 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  34.64 
 
 		 468 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  33.42 
 
 		 503 aa  189  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  34.64 
 
 		 447 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  34.3 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  34.6 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  35.69 
 
 		 490 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.29 
 
 		 472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  34.01 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  28.93 
 
 		 490 aa  176  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  33.53 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  33.91 
 
 		 471 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  32.66 
 
 		 490 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  33.72 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  33.62 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  30.95 
 
 		 741 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  32.69 
 
 		 430 aa  169  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.35 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>